Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT1

PRCD, Progressive rod-cone degeneration protein, humanhuman

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Length 54 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRCDQ00LT1 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PRCDQ00LT1 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRCDQ00LT1 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRCDQ00LT1 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRCDQ00LT1 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRCDQ00LT1 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRCDQ00LT1 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRCDQ00LT1 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRCDQ00LT1 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRCDQ00LT1 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRCDQ00LT1 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRCDQ00LT1 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRCDQ00LT1 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRCDQ00LT1 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRCDQ00LT1 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRCDQ00LT1 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRCDQ00LT1 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRCDQ00LT1 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRCDQ00LT1 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRCDQ00LT1 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRCDQ00LT1 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRCDQ00LT1 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRCDQ00LT1 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PRCDQ00LT1 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRCDQ00LT1 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRCDQ00LT1 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRCDQ00LT1 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRCDQ00LT1 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRCDQ00LT1 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRCDQ00LT1 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRCDQ00LT1 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PRCDQ00LT1 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PRCDQ00LT1 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRCDQ00LT1 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PRCDQ00LT1 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PRCDQ00LT1 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRCDQ00LT1 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRCDQ00LT1 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PRCDQ00LT1 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRCDQ00LT1 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRCDQ00LT1 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRCDQ00LT1 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRCDQ00LT1 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRCDQ00LT1 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRCDQ00LT1 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRCDQ00LT1 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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PRCDQ00LT1 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRCDQ00LT1 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRCDQ00LT1 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRCDQ00LT1 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRCDQ00LT1 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRCDQ00LT1 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRCDQ00LT1 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRCDQ00LT1 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRCDQ00LT1 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRCDQ00LT1 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRCDQ00LT1 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRCDQ00LT1 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRCDQ00LT1 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRCDQ00LT1 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRCDQ00LT1 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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PRCDQ00LT1 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRCDQ00LT1 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRCDQ00LT1 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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PRCDQ00LT1 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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PRCDQ00LT1 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRCDQ00LT1 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRCDQ00LT1 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRCDQ00LT1 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRCDQ00LT1 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRCDQ00LT1 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRCDQ00LT1 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRCDQ00LT1 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRCDQ00LT1 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRCDQ00LT1 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRCDQ00LT1 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PRCDQ00LT1 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRCDQ00LT1 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRCDQ00LT1 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRCDQ00LT1 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRCDQ00LT1 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRCDQ00LT1 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRCDQ00LT1 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRCDQ00LT1 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRCDQ00LT1 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRCDQ00LT1 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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