Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDC42EP1Q00587 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDC42EP1Q00587 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDC42EP1Q00587 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDC42EP1Q00587 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDC42EP1Q00587 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CDC42EP1Q00587 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDC42EP1Q00587 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDC42EP1Q00587 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDC42EP1Q00587 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDC42EP1Q00587 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDC42EP1Q00587 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDC42EP1Q00587 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDC42EP1Q00587 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDC42EP1Q00587 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CDC42EP1Q00587 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDC42EP1Q00587 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDC42EP1Q00587 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDC42EP1Q00587 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDC42EP1Q00587 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDC42EP1Q00587 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDC42EP1Q00587 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDC42EP1Q00587 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDC42EP1Q00587 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDC42EP1Q00587 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDC42EP1Q00587 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDC42EP1Q00587 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDC42EP1Q00587 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDC42EP1Q00587 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDC42EP1Q00587 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDC42EP1Q00587 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDC42EP1Q00587 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDC42EP1Q00587 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDC42EP1Q00587 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CDC42EP1Q00587 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDC42EP1Q00587 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDC42EP1Q00587 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDC42EP1Q00587 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDC42EP1Q00587 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDC42EP1Q00587 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDC42EP1Q00587 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CDC42EP1Q00587 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDC42EP1Q00587 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDC42EP1Q00587 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDC42EP1Q00587 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDC42EP1Q00587 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDC42EP1Q00587 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDC42EP1Q00587 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDC42EP1Q00587 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDC42EP1Q00587 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CDC42EP1Q00587 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDC42EP1Q00587 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDC42EP1Q00587 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDC42EP1Q00587 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDC42EP1Q00587 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDC42EP1Q00587 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDC42EP1Q00587 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDC42EP1Q00587 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDC42EP1Q00587 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDC42EP1Q00587 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDC42EP1Q00587 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDC42EP1Q00587 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDC42EP1Q00587 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDC42EP1Q00587 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CDC42EP1Q00587 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDC42EP1Q00587 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CDC42EP1Q00587 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CDC42EP1Q00587 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CDC42EP1Q00587 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CDC42EP1Q00587 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CDC42EP1Q00587 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CDC42EP1Q00587 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CDC42EP1Q00587 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CDC42EP1Q00587 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CDC42EP1Q00587 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CDC42EP1Q00587 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDC42EP1Q00587 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDC42EP1Q00587 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CDC42EP1Q00587 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDC42EP1Q00587 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDC42EP1Q00587 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDC42EP1Q00587 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDC42EP1Q00587 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDC42EP1Q00587 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDC42EP1Q00587 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDC42EP1Q00587 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDC42EP1Q00587 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CDC42EP1Q00587 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDC42EP1Q00587 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDC42EP1Q00587 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CDC42EP1Q00587 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CDC42EP1Q00587 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CDC42EP1Q00587 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDC42EP1Q00587 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDC42EP1Q00587 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDC42EP1Q00587 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDC42EP1Q00587 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDC42EP1Q00587 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDC42EP1Q00587 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDC42EP1Q00587 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms