Protein–RNA interactions for Protein: P98174

FGD1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD1P98174 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FGD1P98174 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FGD1P98174 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FGD1P98174 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FGD1P98174 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FGD1P98174 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FGD1P98174 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FGD1P98174 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FGD1P98174 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FGD1P98174 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FGD1P98174 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FGD1P98174 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FGD1P98174 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FGD1P98174 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FGD1P98174 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FGD1P98174 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
FGD1P98174 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FGD1P98174 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FGD1P98174 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FGD1P98174 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FGD1P98174 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FGD1P98174 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FGD1P98174 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FGD1P98174 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FGD1P98174 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FGD1P98174 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FGD1P98174 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FGD1P98174 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FGD1P98174 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FGD1P98174 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FGD1P98174 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FGD1P98174 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FGD1P98174 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FGD1P98174 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FGD1P98174 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FGD1P98174 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FGD1P98174 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FGD1P98174 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FGD1P98174 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FGD1P98174 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FGD1P98174 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
FGD1P98174 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FGD1P98174 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
FGD1P98174 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FGD1P98174 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FGD1P98174 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FGD1P98174 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FGD1P98174 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FGD1P98174 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FGD1P98174 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FGD1P98174 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FGD1P98174 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FGD1P98174 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FGD1P98174 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FGD1P98174 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FGD1P98174 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FGD1P98174 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FGD1P98174 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FGD1P98174 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FGD1P98174 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FGD1P98174 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FGD1P98174 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FGD1P98174 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FGD1P98174 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FGD1P98174 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FGD1P98174 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FGD1P98174 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
FGD1P98174 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FGD1P98174 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
FGD1P98174 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FGD1P98174 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FGD1P98174 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FGD1P98174 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FGD1P98174 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FGD1P98174 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FGD1P98174 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FGD1P98174 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FGD1P98174 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FGD1P98174 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FGD1P98174 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FGD1P98174 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FGD1P98174 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FGD1P98174 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FGD1P98174 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FGD1P98174 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FGD1P98174 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FGD1P98174 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
FGD1P98174 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FGD1P98174 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FGD1P98174 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FGD1P98174 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
FGD1P98174 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
FGD1P98174 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
FGD1P98174 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FGD1P98174 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FGD1P98174 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FGD1P98174 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FGD1P98174 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FGD1P98174 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FGD1P98174 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms