Protein–RNA interactions for Protein: P78411

IRX5, Iroquois-class homeodomain protein IRX-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 483 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX5P78411 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IRX5P78411 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IRX5P78411 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IRX5P78411 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IRX5P78411 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IRX5P78411 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IRX5P78411 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IRX5P78411 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IRX5P78411 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IRX5P78411 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IRX5P78411 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IRX5P78411 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IRX5P78411 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IRX5P78411 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IRX5P78411 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IRX5P78411 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IRX5P78411 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IRX5P78411 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
IRX5P78411 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IRX5P78411 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IRX5P78411 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IRX5P78411 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IRX5P78411 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IRX5P78411 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IRX5P78411 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
IRX5P78411 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
IRX5P78411 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
IRX5P78411 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
IRX5P78411 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
IRX5P78411 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
IRX5P78411 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
IRX5P78411 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
IRX5P78411 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
IRX5P78411 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
IRX5P78411 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
IRX5P78411 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
IRX5P78411 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
IRX5P78411 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
IRX5P78411 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC21.33■■□□□ 1
IRX5P78411 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
IRX5P78411 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
IRX5P78411 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IRX5P78411 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IRX5P78411 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IRX5P78411 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC21.32■■□□□ 1
IRX5P78411 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IRX5P78411 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC21.32■■□□□ 1
IRX5P78411 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IRX5P78411 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
IRX5P78411 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IRX5P78411 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC21.32■■□□□ 1
IRX5P78411 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
IRX5P78411 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
IRX5P78411 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
IRX5P78411 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
IRX5P78411 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
IRX5P78411 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IRX5P78411 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IRX5P78411 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
IRX5P78411 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
IRX5P78411 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IRX5P78411 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
IRX5P78411 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IRX5P78411 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
IRX5P78411 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
IRX5P78411 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
IRX5P78411 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
IRX5P78411 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IRX5P78411 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
IRX5P78411 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
IRX5P78411 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IRX5P78411 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
IRX5P78411 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IRX5P78411 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IRX5P78411 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
IRX5P78411 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IRX5P78411 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IRX5P78411 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IRX5P78411 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IRX5P78411 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
IRX5P78411 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IRX5P78411 IFNA4-201ENST00000421715 978 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
IRX5P78411 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
IRX5P78411 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
IRX5P78411 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IRX5P78411 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
IRX5P78411 AP001002.2-201ENST00000625137 386 ntBASIC21.31■■□□□ 1
IRX5P78411 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IRX5P78411 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IRX5P78411 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IRX5P78411 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IRX5P78411 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC21.31■■□□□ 1
IRX5P78411 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IRX5P78411 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
IRX5P78411 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IRX5P78411 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IRX5P78411 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IRX5P78411 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IRX5P78411 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IRX5P78411 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms