Protein–RNA interactions for Protein: P78357

CNTNAP1, Contactin-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP1P78357 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNTNAP1P78357 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNTNAP1P78357 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNTNAP1P78357 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNTNAP1P78357 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CNTNAP1P78357 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNTNAP1P78357 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNTNAP1P78357 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNTNAP1P78357 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNTNAP1P78357 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNTNAP1P78357 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNTNAP1P78357 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNTNAP1P78357 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNTNAP1P78357 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CNTNAP1P78357 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CNTNAP1P78357 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNTNAP1P78357 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CNTNAP1P78357 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNTNAP1P78357 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNTNAP1P78357 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNTNAP1P78357 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNTNAP1P78357 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNTNAP1P78357 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNTNAP1P78357 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNTNAP1P78357 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNTNAP1P78357 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNTNAP1P78357 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNTNAP1P78357 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNTNAP1P78357 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNTNAP1P78357 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNTNAP1P78357 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNTNAP1P78357 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNTNAP1P78357 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CNTNAP1P78357 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CNTNAP1P78357 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CNTNAP1P78357 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNTNAP1P78357 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNTNAP1P78357 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNTNAP1P78357 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNTNAP1P78357 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNTNAP1P78357 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNTNAP1P78357 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNTNAP1P78357 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNTNAP1P78357 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNTNAP1P78357 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNTNAP1P78357 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNTNAP1P78357 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNTNAP1P78357 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNTNAP1P78357 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNTNAP1P78357 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNTNAP1P78357 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNTNAP1P78357 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNTNAP1P78357 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNTNAP1P78357 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNTNAP1P78357 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CNTNAP1P78357 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNTNAP1P78357 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNTNAP1P78357 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNTNAP1P78357 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNTNAP1P78357 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNTNAP1P78357 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNTNAP1P78357 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNTNAP1P78357 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNTNAP1P78357 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNTNAP1P78357 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNTNAP1P78357 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNTNAP1P78357 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNTNAP1P78357 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CNTNAP1P78357 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNTNAP1P78357 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNTNAP1P78357 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNTNAP1P78357 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNTNAP1P78357 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNTNAP1P78357 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNTNAP1P78357 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNTNAP1P78357 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNTNAP1P78357 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNTNAP1P78357 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNTNAP1P78357 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNTNAP1P78357 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNTNAP1P78357 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNTNAP1P78357 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNTNAP1P78357 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNTNAP1P78357 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNTNAP1P78357 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNTNAP1P78357 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNTNAP1P78357 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNTNAP1P78357 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNTNAP1P78357 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNTNAP1P78357 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNTNAP1P78357 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNTNAP1P78357 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CNTNAP1P78357 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNTNAP1P78357 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNTNAP1P78357 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNTNAP1P78357 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNTNAP1P78357 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNTNAP1P78357 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNTNAP1P78357 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNTNAP1P78357 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms