Protein–RNA interactions for Protein: P62330

ARF6, ADP-ribosylation factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF6P62330 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARF6P62330 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ARF6P62330 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ARF6P62330 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARF6P62330 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ARF6P62330 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARF6P62330 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARF6P62330 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARF6P62330 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARF6P62330 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARF6P62330 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ARF6P62330 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARF6P62330 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARF6P62330 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARF6P62330 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARF6P62330 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARF6P62330 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARF6P62330 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ARF6P62330 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ARF6P62330 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ARF6P62330 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ARF6P62330 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARF6P62330 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARF6P62330 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARF6P62330 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARF6P62330 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ARF6P62330 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARF6P62330 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARF6P62330 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARF6P62330 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARF6P62330 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARF6P62330 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARF6P62330 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARF6P62330 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARF6P62330 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARF6P62330 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARF6P62330 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ARF6P62330 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARF6P62330 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARF6P62330 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARF6P62330 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ARF6P62330 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARF6P62330 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARF6P62330 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARF6P62330 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARF6P62330 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARF6P62330 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARF6P62330 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARF6P62330 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARF6P62330 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARF6P62330 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARF6P62330 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARF6P62330 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARF6P62330 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARF6P62330 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARF6P62330 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARF6P62330 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARF6P62330 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARF6P62330 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARF6P62330 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARF6P62330 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARF6P62330 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARF6P62330 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARF6P62330 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARF6P62330 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ARF6P62330 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARF6P62330 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARF6P62330 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ARF6P62330 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARF6P62330 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARF6P62330 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARF6P62330 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARF6P62330 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ARF6P62330 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ARF6P62330 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ARF6P62330 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ARF6P62330 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARF6P62330 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARF6P62330 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARF6P62330 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARF6P62330 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARF6P62330 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARF6P62330 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARF6P62330 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARF6P62330 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARF6P62330 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARF6P62330 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARF6P62330 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ARF6P62330 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARF6P62330 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARF6P62330 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARF6P62330 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARF6P62330 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARF6P62330 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARF6P62330 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARF6P62330 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARF6P62330 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARF6P62330 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARF6P62330 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ARF6P62330 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms