Protein–RNA interactions for Protein: P61968

LMO4, LIM domain transcription factor LMO4, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO4P61968 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LMO4P61968 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LMO4P61968 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
LMO4P61968 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LMO4P61968 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LMO4P61968 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LMO4P61968 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LMO4P61968 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LMO4P61968 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LMO4P61968 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LMO4P61968 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LMO4P61968 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LMO4P61968 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LMO4P61968 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LMO4P61968 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LMO4P61968 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LMO4P61968 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LMO4P61968 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LMO4P61968 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LMO4P61968 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LMO4P61968 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LMO4P61968 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LMO4P61968 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LMO4P61968 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LMO4P61968 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LMO4P61968 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LMO4P61968 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LMO4P61968 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LMO4P61968 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LMO4P61968 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LMO4P61968 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LMO4P61968 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LMO4P61968 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LMO4P61968 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LMO4P61968 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LMO4P61968 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LMO4P61968 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LMO4P61968 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LMO4P61968 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LMO4P61968 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LMO4P61968 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LMO4P61968 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LMO4P61968 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LMO4P61968 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LMO4P61968 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LMO4P61968 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LMO4P61968 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LMO4P61968 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LMO4P61968 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LMO4P61968 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LMO4P61968 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LMO4P61968 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LMO4P61968 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LMO4P61968 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LMO4P61968 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LMO4P61968 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LMO4P61968 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LMO4P61968 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LMO4P61968 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LMO4P61968 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LMO4P61968 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
LMO4P61968 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LMO4P61968 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LMO4P61968 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LMO4P61968 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LMO4P61968 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LMO4P61968 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LMO4P61968 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LMO4P61968 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LMO4P61968 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
LMO4P61968 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LMO4P61968 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LMO4P61968 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LMO4P61968 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LMO4P61968 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LMO4P61968 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LMO4P61968 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LMO4P61968 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LMO4P61968 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LMO4P61968 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LMO4P61968 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LMO4P61968 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LMO4P61968 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LMO4P61968 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LMO4P61968 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LMO4P61968 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LMO4P61968 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LMO4P61968 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LMO4P61968 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LMO4P61968 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LMO4P61968 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LMO4P61968 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LMO4P61968 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LMO4P61968 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LMO4P61968 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LMO4P61968 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
LMO4P61968 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LMO4P61968 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LMO4P61968 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LMO4P61968 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms