Protein–RNA interactions for Protein: P58512

LINC01547, Uncharacterized protein encoded by LINC01547, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01547P58512 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
LINC01547P58512 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
LINC01547P58512 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
LINC01547P58512 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
LINC01547P58512 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
LINC01547P58512 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
LINC01547P58512 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
LINC01547P58512 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
LINC01547P58512 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC11.76□□□□□ -0.53
LINC01547P58512 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
LINC01547P58512 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
LINC01547P58512 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
LINC01547P58512 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
LINC01547P58512 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
LINC01547P58512 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
LINC01547P58512 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
LINC01547P58512 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
LINC01547P58512 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
LINC01547P58512 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
LINC01547P58512 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
LINC01547P58512 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
LINC01547P58512 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
LINC01547P58512 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
LINC01547P58512 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
LINC01547P58512 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
LINC01547P58512 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
LINC01547P58512 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
LINC01547P58512 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
LINC01547P58512 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
LINC01547P58512 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
LINC01547P58512 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
LINC01547P58512 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
LINC01547P58512 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
LINC01547P58512 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
LINC01547P58512 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
LINC01547P58512 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
LINC01547P58512 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
LINC01547P58512 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
LINC01547P58512 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
LINC01547P58512 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
LINC01547P58512 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
LINC01547P58512 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
LINC01547P58512 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
LINC01547P58512 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
LINC01547P58512 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
LINC01547P58512 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
LINC01547P58512 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
LINC01547P58512 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
LINC01547P58512 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
LINC01547P58512 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
LINC01547P58512 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
LINC01547P58512 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
LINC01547P58512 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
LINC01547P58512 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
LINC01547P58512 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
LINC01547P58512 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
LINC01547P58512 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
LINC01547P58512 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
LINC01547P58512 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC11.75□□□□□ -0.53
LINC01547P58512 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
LINC01547P58512 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
LINC01547P58512 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
LINC01547P58512 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
LINC01547P58512 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
LINC01547P58512 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
LINC01547P58512 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
LINC01547P58512 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
LINC01547P58512 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
LINC01547P58512 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
LINC01547P58512 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
LINC01547P58512 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
LINC01547P58512 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
LINC01547P58512 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
LINC01547P58512 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
LINC01547P58512 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
LINC01547P58512 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
LINC01547P58512 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
LINC01547P58512 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
LINC01547P58512 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
LINC01547P58512 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
LINC01547P58512 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
LINC01547P58512 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
LINC01547P58512 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
LINC01547P58512 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
LINC01547P58512 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
LINC01547P58512 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
LINC01547P58512 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
LINC01547P58512 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
LINC01547P58512 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
LINC01547P58512 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
LINC01547P58512 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
LINC01547P58512 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
LINC01547P58512 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
LINC01547P58512 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
LINC01547P58512 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
LINC01547P58512 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
LINC01547P58512 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
LINC01547P58512 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
LINC01547P58512 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
LINC01547P58512 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms