Protein–RNA interactions for Protein: P58499

FAM3B, Protein FAM3B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3BP58499 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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FAM3BP58499 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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FAM3BP58499 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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FAM3BP58499 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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FAM3BP58499 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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FAM3BP58499 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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FAM3BP58499 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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FAM3BP58499 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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FAM3BP58499 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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FAM3BP58499 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM3BP58499 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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