Protein–RNA interactions for Protein: P57740

NUP107, Nuclear pore complex protein Nup107, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP107P57740 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NUP107P57740 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NUP107P57740 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NUP107P57740 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NUP107P57740 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NUP107P57740 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NUP107P57740 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NUP107P57740 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NUP107P57740 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NUP107P57740 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NUP107P57740 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NUP107P57740 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NUP107P57740 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NUP107P57740 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NUP107P57740 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NUP107P57740 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
NUP107P57740 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
NUP107P57740 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
NUP107P57740 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NUP107P57740 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
NUP107P57740 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NUP107P57740 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NUP107P57740 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NUP107P57740 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NUP107P57740 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NUP107P57740 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NUP107P57740 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NUP107P57740 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NUP107P57740 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NUP107P57740 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NUP107P57740 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NUP107P57740 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
NUP107P57740 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NUP107P57740 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NUP107P57740 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NUP107P57740 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NUP107P57740 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NUP107P57740 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NUP107P57740 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NUP107P57740 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
NUP107P57740 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NUP107P57740 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NUP107P57740 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NUP107P57740 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NUP107P57740 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NUP107P57740 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NUP107P57740 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NUP107P57740 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NUP107P57740 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NUP107P57740 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NUP107P57740 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NUP107P57740 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NUP107P57740 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NUP107P57740 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
NUP107P57740 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NUP107P57740 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NUP107P57740 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NUP107P57740 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NUP107P57740 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NUP107P57740 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NUP107P57740 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NUP107P57740 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NUP107P57740 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NUP107P57740 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NUP107P57740 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NUP107P57740 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NUP107P57740 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NUP107P57740 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NUP107P57740 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NUP107P57740 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NUP107P57740 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NUP107P57740 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
NUP107P57740 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NUP107P57740 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NUP107P57740 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NUP107P57740 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NUP107P57740 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NUP107P57740 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NUP107P57740 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NUP107P57740 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NUP107P57740 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NUP107P57740 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NUP107P57740 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NUP107P57740 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NUP107P57740 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NUP107P57740 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NUP107P57740 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NUP107P57740 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NUP107P57740 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NUP107P57740 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NUP107P57740 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NUP107P57740 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
NUP107P57740 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NUP107P57740 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NUP107P57740 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NUP107P57740 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
NUP107P57740 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
NUP107P57740 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NUP107P57740 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NUP107P57740 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms