Protein–RNA interactions for Protein: P57739

CLDN2, Claudin-2, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN2P57739 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN2P57739 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN2P57739 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN2P57739 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN2P57739 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN2P57739 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN2P57739 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLDN2P57739 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN2P57739 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN2P57739 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN2P57739 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN2P57739 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN2P57739 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN2P57739 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN2P57739 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN2P57739 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN2P57739 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN2P57739 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN2P57739 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN2P57739 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN2P57739 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN2P57739 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN2P57739 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN2P57739 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN2P57739 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN2P57739 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN2P57739 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN2P57739 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN2P57739 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN2P57739 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN2P57739 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN2P57739 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLDN2P57739 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN2P57739 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN2P57739 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN2P57739 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN2P57739 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN2P57739 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN2P57739 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN2P57739 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN2P57739 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN2P57739 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN2P57739 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN2P57739 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN2P57739 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN2P57739 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN2P57739 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN2P57739 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN2P57739 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN2P57739 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN2P57739 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN2P57739 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN2P57739 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CLDN2P57739 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN2P57739 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN2P57739 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN2P57739 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN2P57739 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN2P57739 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN2P57739 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN2P57739 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN2P57739 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN2P57739 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN2P57739 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN2P57739 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN2P57739 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN2P57739 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN2P57739 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN2P57739 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN2P57739 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN2P57739 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN2P57739 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN2P57739 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN2P57739 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN2P57739 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN2P57739 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN2P57739 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN2P57739 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN2P57739 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN2P57739 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLDN2P57739 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLDN2P57739 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLDN2P57739 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLDN2P57739 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLDN2P57739 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLDN2P57739 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLDN2P57739 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLDN2P57739 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLDN2P57739 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLDN2P57739 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLDN2P57739 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLDN2P57739 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLDN2P57739 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLDN2P57739 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLDN2P57739 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLDN2P57739 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CLDN2P57739 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLDN2P57739 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLDN2P57739 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLDN2P57739 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms