Protein–RNA interactions for Protein: P56597

NME5, Nucleoside diphosphate kinase homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME5P56597 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NME5P56597 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NME5P56597 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NME5P56597 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NME5P56597 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NME5P56597 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NME5P56597 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NME5P56597 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NME5P56597 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NME5P56597 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NME5P56597 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NME5P56597 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NME5P56597 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NME5P56597 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NME5P56597 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NME5P56597 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NME5P56597 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NME5P56597 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NME5P56597 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NME5P56597 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NME5P56597 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NME5P56597 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NME5P56597 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NME5P56597 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NME5P56597 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NME5P56597 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NME5P56597 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NME5P56597 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NME5P56597 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NME5P56597 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NME5P56597 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NME5P56597 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NME5P56597 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
NME5P56597 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
NME5P56597 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NME5P56597 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NME5P56597 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NME5P56597 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NME5P56597 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NME5P56597 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NME5P56597 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
NME5P56597 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NME5P56597 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NME5P56597 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NME5P56597 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NME5P56597 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NME5P56597 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NME5P56597 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NME5P56597 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NME5P56597 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NME5P56597 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
NME5P56597 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NME5P56597 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NME5P56597 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NME5P56597 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NME5P56597 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NME5P56597 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NME5P56597 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NME5P56597 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NME5P56597 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NME5P56597 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NME5P56597 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NME5P56597 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NME5P56597 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NME5P56597 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NME5P56597 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NME5P56597 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NME5P56597 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NME5P56597 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NME5P56597 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
NME5P56597 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NME5P56597 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NME5P56597 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NME5P56597 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NME5P56597 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NME5P56597 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NME5P56597 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NME5P56597 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NME5P56597 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NME5P56597 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NME5P56597 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NME5P56597 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NME5P56597 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NME5P56597 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NME5P56597 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NME5P56597 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NME5P56597 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NME5P56597 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NME5P56597 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NME5P56597 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NME5P56597 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NME5P56597 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NME5P56597 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NME5P56597 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NME5P56597 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NME5P56597 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NME5P56597 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NME5P56597 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NME5P56597 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NME5P56597 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms