Protein–RNA interactions for Protein: P56159

GFRA1, GDNF family receptor alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA1P56159 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GFRA1P56159 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GFRA1P56159 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GFRA1P56159 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GFRA1P56159 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GFRA1P56159 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GFRA1P56159 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GFRA1P56159 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
GFRA1P56159 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
GFRA1P56159 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
GFRA1P56159 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
GFRA1P56159 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GFRA1P56159 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GFRA1P56159 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GFRA1P56159 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GFRA1P56159 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GFRA1P56159 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
GFRA1P56159 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GFRA1P56159 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GFRA1P56159 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GFRA1P56159 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GFRA1P56159 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GFRA1P56159 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GFRA1P56159 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GFRA1P56159 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GFRA1P56159 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GFRA1P56159 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GFRA1P56159 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GFRA1P56159 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GFRA1P56159 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GFRA1P56159 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GFRA1P56159 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GFRA1P56159 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
GFRA1P56159 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
GFRA1P56159 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GFRA1P56159 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GFRA1P56159 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GFRA1P56159 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
GFRA1P56159 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GFRA1P56159 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GFRA1P56159 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GFRA1P56159 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GFRA1P56159 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GFRA1P56159 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GFRA1P56159 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GFRA1P56159 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GFRA1P56159 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GFRA1P56159 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GFRA1P56159 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GFRA1P56159 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GFRA1P56159 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GFRA1P56159 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GFRA1P56159 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GFRA1P56159 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GFRA1P56159 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GFRA1P56159 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GFRA1P56159 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GFRA1P56159 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GFRA1P56159 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GFRA1P56159 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GFRA1P56159 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GFRA1P56159 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GFRA1P56159 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GFRA1P56159 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GFRA1P56159 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GFRA1P56159 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GFRA1P56159 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GFRA1P56159 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GFRA1P56159 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GFRA1P56159 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GFRA1P56159 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GFRA1P56159 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GFRA1P56159 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
GFRA1P56159 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GFRA1P56159 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GFRA1P56159 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GFRA1P56159 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GFRA1P56159 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GFRA1P56159 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GFRA1P56159 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GFRA1P56159 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GFRA1P56159 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GFRA1P56159 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GFRA1P56159 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
GFRA1P56159 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GFRA1P56159 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GFRA1P56159 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GFRA1P56159 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GFRA1P56159 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
GFRA1P56159 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GFRA1P56159 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
GFRA1P56159 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GFRA1P56159 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GFRA1P56159 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GFRA1P56159 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GFRA1P56159 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GFRA1P56159 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GFRA1P56159 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GFRA1P56159 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GFRA1P56159 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms