Protein–RNA interactions for Protein: P52657

GTF2A2, Transcription initiation factor IIA subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A2P52657 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTF2A2P52657 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTF2A2P52657 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTF2A2P52657 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTF2A2P52657 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTF2A2P52657 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
GTF2A2P52657 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTF2A2P52657 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTF2A2P52657 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTF2A2P52657 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTF2A2P52657 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTF2A2P52657 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTF2A2P52657 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTF2A2P52657 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTF2A2P52657 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTF2A2P52657 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTF2A2P52657 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTF2A2P52657 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTF2A2P52657 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTF2A2P52657 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTF2A2P52657 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTF2A2P52657 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
GTF2A2P52657 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTF2A2P52657 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTF2A2P52657 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTF2A2P52657 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTF2A2P52657 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTF2A2P52657 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTF2A2P52657 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTF2A2P52657 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTF2A2P52657 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTF2A2P52657 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
GTF2A2P52657 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTF2A2P52657 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTF2A2P52657 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTF2A2P52657 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTF2A2P52657 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTF2A2P52657 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTF2A2P52657 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTF2A2P52657 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTF2A2P52657 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTF2A2P52657 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTF2A2P52657 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTF2A2P52657 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTF2A2P52657 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTF2A2P52657 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTF2A2P52657 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
GTF2A2P52657 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
GTF2A2P52657 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
GTF2A2P52657 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTF2A2P52657 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTF2A2P52657 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTF2A2P52657 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTF2A2P52657 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTF2A2P52657 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTF2A2P52657 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTF2A2P52657 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTF2A2P52657 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTF2A2P52657 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF2A2P52657 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF2A2P52657 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF2A2P52657 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF2A2P52657 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF2A2P52657 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF2A2P52657 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF2A2P52657 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF2A2P52657 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF2A2P52657 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF2A2P52657 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF2A2P52657 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF2A2P52657 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF2A2P52657 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF2A2P52657 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF2A2P52657 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF2A2P52657 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF2A2P52657 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF2A2P52657 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF2A2P52657 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF2A2P52657 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF2A2P52657 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF2A2P52657 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF2A2P52657 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF2A2P52657 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF2A2P52657 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF2A2P52657 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF2A2P52657 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF2A2P52657 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF2A2P52657 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF2A2P52657 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF2A2P52657 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF2A2P52657 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF2A2P52657 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF2A2P52657 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF2A2P52657 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
GTF2A2P52657 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
GTF2A2P52657 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF2A2P52657 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF2A2P52657 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF2A2P52657 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF2A2P52657 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms