Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
SMARCA2P51531 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
SMARCA2P51531 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
SMARCA2P51531 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
SMARCA2P51531 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.89
SMARCA2P51531 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.89
SMARCA2P51531 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
SMARCA2P51531 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC33.13■■■□□ 2.89
SMARCA2P51531 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
SMARCA2P51531 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
SMARCA2P51531 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
SMARCA2P51531 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
SMARCA2P51531 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
SMARCA2P51531 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
SMARCA2P51531 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
SMARCA2P51531 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
SMARCA2P51531 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
SMARCA2P51531 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
SMARCA2P51531 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
SMARCA2P51531 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
SMARCA2P51531 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
SMARCA2P51531 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
SMARCA2P51531 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
SMARCA2P51531 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
SMARCA2P51531 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
SMARCA2P51531 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
SMARCA2P51531 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
SMARCA2P51531 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
SMARCA2P51531 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
SMARCA2P51531 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
SMARCA2P51531 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
SMARCA2P51531 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
SMARCA2P51531 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
SMARCA2P51531 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
SMARCA2P51531 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
SMARCA2P51531 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
SMARCA2P51531 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
SMARCA2P51531 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
SMARCA2P51531 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
SMARCA2P51531 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
SMARCA2P51531 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
SMARCA2P51531 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
SMARCA2P51531 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
SMARCA2P51531 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
SMARCA2P51531 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.1■■■□□ 2.89
SMARCA2P51531 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
SMARCA2P51531 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
SMARCA2P51531 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
SMARCA2P51531 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
SMARCA2P51531 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
SMARCA2P51531 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
SMARCA2P51531 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
SMARCA2P51531 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
SMARCA2P51531 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
SMARCA2P51531 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
SMARCA2P51531 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
SMARCA2P51531 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
SMARCA2P51531 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC33.09■■■□□ 2.89
SMARCA2P51531 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
SMARCA2P51531 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
SMARCA2P51531 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
SMARCA2P51531 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
SMARCA2P51531 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
SMARCA2P51531 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
SMARCA2P51531 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
SMARCA2P51531 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
SMARCA2P51531 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC33.09■■■□□ 2.89
SMARCA2P51531 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
SMARCA2P51531 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC33.09■■■□□ 2.89
SMARCA2P51531 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
SMARCA2P51531 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
SMARCA2P51531 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
SMARCA2P51531 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
SMARCA2P51531 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
SMARCA2P51531 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
SMARCA2P51531 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
SMARCA2P51531 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
SMARCA2P51531 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
SMARCA2P51531 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
SMARCA2P51531 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
SMARCA2P51531 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.89
SMARCA2P51531 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
SMARCA2P51531 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
SMARCA2P51531 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
SMARCA2P51531 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
SMARCA2P51531 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC33.07■■■□□ 2.88
SMARCA2P51531 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
SMARCA2P51531 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
SMARCA2P51531 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
SMARCA2P51531 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
SMARCA2P51531 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
SMARCA2P51531 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
SMARCA2P51531 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
SMARCA2P51531 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
SMARCA2P51531 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
SMARCA2P51531 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
SMARCA2P51531 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
SMARCA2P51531 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
SMARCA2P51531 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
SMARCA2P51531 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms