Protein–RNA interactions for Protein: P49189

ALDH9A1, 4-trimethylaminobutyraldehyde dehydrogenase, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH9A1P49189 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ALDH9A1P49189 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ALDH9A1P49189 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ALDH9A1P49189 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ALDH9A1P49189 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ALDH9A1P49189 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ALDH9A1P49189 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ALDH9A1P49189 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ALDH9A1P49189 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ALDH9A1P49189 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ALDH9A1P49189 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ALDH9A1P49189 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ALDH9A1P49189 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ALDH9A1P49189 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ALDH9A1P49189 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ALDH9A1P49189 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ALDH9A1P49189 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ALDH9A1P49189 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ALDH9A1P49189 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ALDH9A1P49189 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ALDH9A1P49189 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ALDH9A1P49189 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ALDH9A1P49189 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ALDH9A1P49189 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ALDH9A1P49189 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ALDH9A1P49189 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ALDH9A1P49189 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ALDH9A1P49189 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ALDH9A1P49189 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ALDH9A1P49189 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ALDH9A1P49189 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ALDH9A1P49189 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ALDH9A1P49189 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ALDH9A1P49189 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ALDH9A1P49189 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ALDH9A1P49189 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ALDH9A1P49189 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ALDH9A1P49189 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ALDH9A1P49189 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ALDH9A1P49189 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ALDH9A1P49189 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ALDH9A1P49189 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ALDH9A1P49189 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ALDH9A1P49189 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ALDH9A1P49189 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ALDH9A1P49189 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ALDH9A1P49189 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ALDH9A1P49189 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ALDH9A1P49189 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ALDH9A1P49189 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ALDH9A1P49189 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ALDH9A1P49189 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ALDH9A1P49189 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ALDH9A1P49189 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ALDH9A1P49189 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ALDH9A1P49189 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ALDH9A1P49189 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ALDH9A1P49189 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ALDH9A1P49189 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ALDH9A1P49189 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ALDH9A1P49189 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ALDH9A1P49189 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ALDH9A1P49189 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ALDH9A1P49189 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ALDH9A1P49189 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ALDH9A1P49189 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ALDH9A1P49189 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ALDH9A1P49189 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ALDH9A1P49189 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ALDH9A1P49189 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ALDH9A1P49189 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ALDH9A1P49189 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ALDH9A1P49189 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ALDH9A1P49189 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ALDH9A1P49189 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ALDH9A1P49189 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ALDH9A1P49189 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ALDH9A1P49189 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ALDH9A1P49189 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ALDH9A1P49189 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ALDH9A1P49189 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ALDH9A1P49189 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ALDH9A1P49189 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ALDH9A1P49189 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ALDH9A1P49189 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ALDH9A1P49189 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ALDH9A1P49189 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ALDH9A1P49189 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ALDH9A1P49189 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ALDH9A1P49189 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ALDH9A1P49189 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ALDH9A1P49189 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ALDH9A1P49189 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ALDH9A1P49189 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ALDH9A1P49189 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ALDH9A1P49189 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ALDH9A1P49189 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ALDH9A1P49189 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ALDH9A1P49189 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ALDH9A1P49189 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms