Protein–RNA interactions for Protein: P46934

NEDD4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, humanhuman

Predictions only

Length 1,319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4P46934 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NEDD4P46934 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NEDD4P46934 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NEDD4P46934 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NEDD4P46934 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NEDD4P46934 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NEDD4P46934 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NEDD4P46934 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NEDD4P46934 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NEDD4P46934 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NEDD4P46934 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NEDD4P46934 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NEDD4P46934 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NEDD4P46934 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NEDD4P46934 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NEDD4P46934 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NEDD4P46934 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NEDD4P46934 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
NEDD4P46934 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
NEDD4P46934 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NEDD4P46934 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NEDD4P46934 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NEDD4P46934 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NEDD4P46934 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NEDD4P46934 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NEDD4P46934 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEDD4P46934 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEDD4P46934 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEDD4P46934 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEDD4P46934 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEDD4P46934 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEDD4P46934 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NEDD4P46934 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEDD4P46934 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEDD4P46934 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEDD4P46934 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEDD4P46934 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEDD4P46934 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEDD4P46934 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEDD4P46934 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NEDD4P46934 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEDD4P46934 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEDD4P46934 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NEDD4P46934 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEDD4P46934 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEDD4P46934 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEDD4P46934 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEDD4P46934 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEDD4P46934 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEDD4P46934 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEDD4P46934 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEDD4P46934 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEDD4P46934 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEDD4P46934 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEDD4P46934 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEDD4P46934 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
NEDD4P46934 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEDD4P46934 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEDD4P46934 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEDD4P46934 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEDD4P46934 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
NEDD4P46934 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEDD4P46934 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEDD4P46934 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEDD4P46934 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEDD4P46934 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEDD4P46934 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEDD4P46934 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEDD4P46934 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEDD4P46934 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEDD4P46934 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEDD4P46934 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEDD4P46934 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEDD4P46934 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEDD4P46934 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEDD4P46934 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEDD4P46934 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEDD4P46934 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEDD4P46934 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEDD4P46934 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEDD4P46934 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEDD4P46934 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEDD4P46934 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEDD4P46934 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEDD4P46934 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEDD4P46934 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEDD4P46934 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEDD4P46934 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEDD4P46934 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEDD4P46934 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEDD4P46934 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEDD4P46934 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEDD4P46934 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEDD4P46934 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEDD4P46934 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NEDD4P46934 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NEDD4P46934 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NEDD4P46934 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NEDD4P46934 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NEDD4P46934 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms