Protein–RNA interactions for Protein: P46926

GNPDA1, Glucosamine-6-phosphate isomerase 1, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPDA1P46926 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GNPDA1P46926 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GNPDA1P46926 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GNPDA1P46926 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GNPDA1P46926 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GNPDA1P46926 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
GNPDA1P46926 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GNPDA1P46926 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GNPDA1P46926 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
GNPDA1P46926 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GNPDA1P46926 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
GNPDA1P46926 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GNPDA1P46926 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GNPDA1P46926 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GNPDA1P46926 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GNPDA1P46926 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GNPDA1P46926 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GNPDA1P46926 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
GNPDA1P46926 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GNPDA1P46926 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GNPDA1P46926 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GNPDA1P46926 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GNPDA1P46926 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
GNPDA1P46926 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GNPDA1P46926 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GNPDA1P46926 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GNPDA1P46926 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
GNPDA1P46926 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GNPDA1P46926 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GNPDA1P46926 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GNPDA1P46926 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GNPDA1P46926 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GNPDA1P46926 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GNPDA1P46926 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GNPDA1P46926 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GNPDA1P46926 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GNPDA1P46926 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
GNPDA1P46926 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GNPDA1P46926 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GNPDA1P46926 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GNPDA1P46926 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GNPDA1P46926 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GNPDA1P46926 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GNPDA1P46926 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GNPDA1P46926 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GNPDA1P46926 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GNPDA1P46926 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GNPDA1P46926 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GNPDA1P46926 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GNPDA1P46926 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GNPDA1P46926 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GNPDA1P46926 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GNPDA1P46926 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GNPDA1P46926 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GNPDA1P46926 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GNPDA1P46926 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GNPDA1P46926 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GNPDA1P46926 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GNPDA1P46926 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GNPDA1P46926 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GNPDA1P46926 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
GNPDA1P46926 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GNPDA1P46926 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GNPDA1P46926 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GNPDA1P46926 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GNPDA1P46926 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GNPDA1P46926 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GNPDA1P46926 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GNPDA1P46926 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GNPDA1P46926 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GNPDA1P46926 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GNPDA1P46926 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
GNPDA1P46926 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GNPDA1P46926 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GNPDA1P46926 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GNPDA1P46926 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GNPDA1P46926 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GNPDA1P46926 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GNPDA1P46926 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GNPDA1P46926 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
GNPDA1P46926 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GNPDA1P46926 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GNPDA1P46926 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GNPDA1P46926 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GNPDA1P46926 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
GNPDA1P46926 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GNPDA1P46926 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GNPDA1P46926 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GNPDA1P46926 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
GNPDA1P46926 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GNPDA1P46926 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GNPDA1P46926 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GNPDA1P46926 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GNPDA1P46926 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GNPDA1P46926 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GNPDA1P46926 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GNPDA1P46926 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GNPDA1P46926 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
GNPDA1P46926 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GNPDA1P46926 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms