Protein–RNA interactions for Protein: P42025

ACTR1B, Beta-centractin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR1BP42025 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACTR1BP42025 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTR1BP42025 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTR1BP42025 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTR1BP42025 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTR1BP42025 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTR1BP42025 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTR1BP42025 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTR1BP42025 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTR1BP42025 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTR1BP42025 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTR1BP42025 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTR1BP42025 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTR1BP42025 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTR1BP42025 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTR1BP42025 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTR1BP42025 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTR1BP42025 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTR1BP42025 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTR1BP42025 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTR1BP42025 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTR1BP42025 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTR1BP42025 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTR1BP42025 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTR1BP42025 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTR1BP42025 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTR1BP42025 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTR1BP42025 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTR1BP42025 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTR1BP42025 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACTR1BP42025 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ACTR1BP42025 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACTR1BP42025 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACTR1BP42025 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACTR1BP42025 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACTR1BP42025 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACTR1BP42025 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACTR1BP42025 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACTR1BP42025 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACTR1BP42025 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACTR1BP42025 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ACTR1BP42025 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACTR1BP42025 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACTR1BP42025 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACTR1BP42025 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACTR1BP42025 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACTR1BP42025 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ACTR1BP42025 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACTR1BP42025 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACTR1BP42025 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACTR1BP42025 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACTR1BP42025 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACTR1BP42025 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ACTR1BP42025 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACTR1BP42025 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACTR1BP42025 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACTR1BP42025 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACTR1BP42025 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACTR1BP42025 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACTR1BP42025 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACTR1BP42025 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACTR1BP42025 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACTR1BP42025 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACTR1BP42025 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACTR1BP42025 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ACTR1BP42025 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACTR1BP42025 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACTR1BP42025 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACTR1BP42025 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACTR1BP42025 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACTR1BP42025 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACTR1BP42025 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACTR1BP42025 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACTR1BP42025 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACTR1BP42025 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ACTR1BP42025 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACTR1BP42025 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACTR1BP42025 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACTR1BP42025 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACTR1BP42025 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACTR1BP42025 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACTR1BP42025 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACTR1BP42025 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACTR1BP42025 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACTR1BP42025 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACTR1BP42025 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACTR1BP42025 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACTR1BP42025 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ACTR1BP42025 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACTR1BP42025 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACTR1BP42025 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACTR1BP42025 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ACTR1BP42025 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACTR1BP42025 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACTR1BP42025 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACTR1BP42025 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACTR1BP42025 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACTR1BP42025 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACTR1BP42025 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACTR1BP42025 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.5 ms