Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HOXC13P31276 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HOXC13P31276 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HOXC13P31276 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HOXC13P31276 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HOXC13P31276 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HOXC13P31276 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HOXC13P31276 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HOXC13P31276 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HOXC13P31276 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
HOXC13P31276 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HOXC13P31276 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HOXC13P31276 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
HOXC13P31276 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
HOXC13P31276 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
HOXC13P31276 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
HOXC13P31276 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
HOXC13P31276 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
HOXC13P31276 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
HOXC13P31276 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
HOXC13P31276 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
HOXC13P31276 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
HOXC13P31276 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HOXC13P31276 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HOXC13P31276 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HOXC13P31276 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HOXC13P31276 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
HOXC13P31276 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HOXC13P31276 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HOXC13P31276 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HOXC13P31276 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
HOXC13P31276 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HOXC13P31276 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HOXC13P31276 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HOXC13P31276 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
HOXC13P31276 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HOXC13P31276 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HOXC13P31276 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HOXC13P31276 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HOXC13P31276 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HOXC13P31276 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HOXC13P31276 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HOXC13P31276 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HOXC13P31276 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HOXC13P31276 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HOXC13P31276 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HOXC13P31276 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXC13P31276 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXC13P31276 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXC13P31276 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXC13P31276 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXC13P31276 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXC13P31276 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXC13P31276 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXC13P31276 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXC13P31276 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXC13P31276 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXC13P31276 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXC13P31276 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXC13P31276 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXC13P31276 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXC13P31276 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXC13P31276 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXC13P31276 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXC13P31276 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXC13P31276 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXC13P31276 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXC13P31276 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXC13P31276 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXC13P31276 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXC13P31276 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXC13P31276 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXC13P31276 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXC13P31276 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXC13P31276 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXC13P31276 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXC13P31276 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXC13P31276 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXC13P31276 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXC13P31276 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXC13P31276 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXC13P31276 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXC13P31276 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXC13P31276 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXC13P31276 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXC13P31276 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXC13P31276 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXC13P31276 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXC13P31276 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXC13P31276 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXC13P31276 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXC13P31276 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXC13P31276 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXC13P31276 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXC13P31276 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXC13P31276 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXC13P31276 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXC13P31276 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXC13P31276 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXC13P31276 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms