Protein–RNA interactions for Protein: P30408

TM4SF1, Transmembrane 4 L6 family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF1P30408 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TM4SF1P30408 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TM4SF1P30408 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TM4SF1P30408 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TM4SF1P30408 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TM4SF1P30408 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TM4SF1P30408 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TM4SF1P30408 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TM4SF1P30408 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TM4SF1P30408 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TM4SF1P30408 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TM4SF1P30408 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TM4SF1P30408 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TM4SF1P30408 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TM4SF1P30408 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TM4SF1P30408 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TM4SF1P30408 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TM4SF1P30408 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TM4SF1P30408 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TM4SF1P30408 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TM4SF1P30408 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TM4SF1P30408 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TM4SF1P30408 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TM4SF1P30408 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TM4SF1P30408 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TM4SF1P30408 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TM4SF1P30408 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TM4SF1P30408 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TM4SF1P30408 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TM4SF1P30408 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TM4SF1P30408 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TM4SF1P30408 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TM4SF1P30408 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TM4SF1P30408 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TM4SF1P30408 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TM4SF1P30408 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TM4SF1P30408 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TM4SF1P30408 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TM4SF1P30408 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TM4SF1P30408 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TM4SF1P30408 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TM4SF1P30408 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TM4SF1P30408 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TM4SF1P30408 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TM4SF1P30408 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TM4SF1P30408 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TM4SF1P30408 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TM4SF1P30408 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TM4SF1P30408 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TM4SF1P30408 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TM4SF1P30408 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TM4SF1P30408 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TM4SF1P30408 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TM4SF1P30408 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TM4SF1P30408 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TM4SF1P30408 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TM4SF1P30408 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TM4SF1P30408 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TM4SF1P30408 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TM4SF1P30408 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TM4SF1P30408 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TM4SF1P30408 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TM4SF1P30408 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TM4SF1P30408 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TM4SF1P30408 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TM4SF1P30408 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TM4SF1P30408 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TM4SF1P30408 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TM4SF1P30408 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TM4SF1P30408 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TM4SF1P30408 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TM4SF1P30408 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TM4SF1P30408 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TM4SF1P30408 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TM4SF1P30408 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TM4SF1P30408 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TM4SF1P30408 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TM4SF1P30408 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TM4SF1P30408 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TM4SF1P30408 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TM4SF1P30408 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TM4SF1P30408 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TM4SF1P30408 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TM4SF1P30408 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TM4SF1P30408 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TM4SF1P30408 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TM4SF1P30408 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TM4SF1P30408 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TM4SF1P30408 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TM4SF1P30408 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TM4SF1P30408 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TM4SF1P30408 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TM4SF1P30408 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TM4SF1P30408 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TM4SF1P30408 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TM4SF1P30408 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TM4SF1P30408 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TM4SF1P30408 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TM4SF1P30408 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TM4SF1P30408 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms