Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLR2AP24928 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLR2AP24928 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLR2AP24928 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLR2AP24928 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLR2AP24928 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLR2AP24928 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLR2AP24928 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLR2AP24928 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLR2AP24928 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLR2AP24928 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLR2AP24928 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLR2AP24928 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLR2AP24928 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLR2AP24928 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLR2AP24928 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLR2AP24928 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR2AP24928 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR2AP24928 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR2AP24928 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR2AP24928 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR2AP24928 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR2AP24928 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR2AP24928 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR2AP24928 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR2AP24928 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR2AP24928 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR2AP24928 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR2AP24928 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR2AP24928 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR2AP24928 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR2AP24928 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR2AP24928 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR2AP24928 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR2AP24928 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR2AP24928 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR2AP24928 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR2AP24928 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR2AP24928 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR2AP24928 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR2AP24928 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR2AP24928 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR2AP24928 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR2AP24928 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR2AP24928 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR2AP24928 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
POLR2AP24928 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
POLR2AP24928 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
POLR2AP24928 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
POLR2AP24928 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
POLR2AP24928 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
POLR2AP24928 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
POLR2AP24928 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
POLR2AP24928 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
POLR2AP24928 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
POLR2AP24928 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
POLR2AP24928 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
POLR2AP24928 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
POLR2AP24928 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
POLR2AP24928 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
POLR2AP24928 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR2AP24928 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR2AP24928 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR2AP24928 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR2AP24928 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR2AP24928 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR2AP24928 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR2AP24928 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR2AP24928 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR2AP24928 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR2AP24928 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR2AP24928 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR2AP24928 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR2AP24928 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR2AP24928 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR2AP24928 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR2AP24928 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR2AP24928 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR2AP24928 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR2AP24928 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR2AP24928 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR2AP24928 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR2AP24928 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR2AP24928 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR2AP24928 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR2AP24928 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR2AP24928 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR2AP24928 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR2AP24928 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR2AP24928 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR2AP24928 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR2AP24928 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR2AP24928 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR2AP24928 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR2AP24928 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR2AP24928 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR2AP24928 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR2AP24928 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR2AP24928 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR2AP24928 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms