Protein–RNA interactions for Protein: P22607

FGFR3, Fibroblast growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 806 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR3P22607 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FGFR3P22607 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FGFR3P22607 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FGFR3P22607 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FGFR3P22607 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FGFR3P22607 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FGFR3P22607 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FGFR3P22607 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FGFR3P22607 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FGFR3P22607 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FGFR3P22607 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FGFR3P22607 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FGFR3P22607 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FGFR3P22607 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FGFR3P22607 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FGFR3P22607 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FGFR3P22607 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FGFR3P22607 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FGFR3P22607 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FGFR3P22607 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FGFR3P22607 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FGFR3P22607 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FGFR3P22607 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FGFR3P22607 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FGFR3P22607 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FGFR3P22607 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FGFR3P22607 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
FGFR3P22607 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FGFR3P22607 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FGFR3P22607 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FGFR3P22607 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
FGFR3P22607 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
FGFR3P22607 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
FGFR3P22607 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FGFR3P22607 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
FGFR3P22607 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FGFR3P22607 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FGFR3P22607 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FGFR3P22607 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FGFR3P22607 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
FGFR3P22607 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
FGFR3P22607 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
FGFR3P22607 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FGFR3P22607 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
FGFR3P22607 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FGFR3P22607 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FGFR3P22607 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
FGFR3P22607 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
FGFR3P22607 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FGFR3P22607 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
FGFR3P22607 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
FGFR3P22607 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
FGFR3P22607 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
FGFR3P22607 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
FGFR3P22607 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FGFR3P22607 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FGFR3P22607 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
FGFR3P22607 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FGFR3P22607 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
FGFR3P22607 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
FGFR3P22607 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FGFR3P22607 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
FGFR3P22607 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FGFR3P22607 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
FGFR3P22607 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
FGFR3P22607 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
FGFR3P22607 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
FGFR3P22607 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
FGFR3P22607 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
FGFR3P22607 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
FGFR3P22607 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
FGFR3P22607 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
FGFR3P22607 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
FGFR3P22607 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
FGFR3P22607 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
FGFR3P22607 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
FGFR3P22607 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
FGFR3P22607 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
FGFR3P22607 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
FGFR3P22607 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
FGFR3P22607 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
FGFR3P22607 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
FGFR3P22607 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
FGFR3P22607 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
FGFR3P22607 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
FGFR3P22607 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
FGFR3P22607 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
FGFR3P22607 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
FGFR3P22607 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
FGFR3P22607 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
FGFR3P22607 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
FGFR3P22607 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
FGFR3P22607 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
FGFR3P22607 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
FGFR3P22607 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
FGFR3P22607 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
FGFR3P22607 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
FGFR3P22607 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
FGFR3P22607 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
FGFR3P22607 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms