Protein–RNA interactions for Protein: P21359

NF1, Neurofibromin, humanhuman

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Length 2,839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NF1P21359 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NF1P21359 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NF1P21359 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NF1P21359 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NF1P21359 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NF1P21359 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NF1P21359 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NF1P21359 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NF1P21359 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NF1P21359 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NF1P21359 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NF1P21359 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NF1P21359 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NF1P21359 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NF1P21359 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NF1P21359 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NF1P21359 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NF1P21359 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NF1P21359 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NF1P21359 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NF1P21359 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NF1P21359 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NF1P21359 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NF1P21359 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NF1P21359 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NF1P21359 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NF1P21359 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NF1P21359 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NF1P21359 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NF1P21359 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NF1P21359 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NF1P21359 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NF1P21359 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NF1P21359 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NF1P21359 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NF1P21359 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NF1P21359 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NF1P21359 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NF1P21359 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NF1P21359 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NF1P21359 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NF1P21359 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NF1P21359 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NF1P21359 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NF1P21359 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NF1P21359 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NF1P21359 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NF1P21359 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NF1P21359 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NF1P21359 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NF1P21359 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NF1P21359 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NF1P21359 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NF1P21359 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NF1P21359 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NF1P21359 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NF1P21359 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NF1P21359 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NF1P21359 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NF1P21359 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NF1P21359 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NF1P21359 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NF1P21359 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NF1P21359 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NF1P21359 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NF1P21359 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NF1P21359 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NF1P21359 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NF1P21359 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NF1P21359 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NF1P21359 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NF1P21359 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NF1P21359 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NF1P21359 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NF1P21359 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NF1P21359 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NF1P21359 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NF1P21359 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NF1P21359 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NF1P21359 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NF1P21359 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NF1P21359 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NF1P21359 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NF1P21359 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NF1P21359 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NF1P21359 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NF1P21359 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NF1P21359 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NF1P21359 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NF1P21359 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NF1P21359 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NF1P21359 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NF1P21359 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NF1P21359 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NF1P21359 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NF1P21359 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NF1P21359 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NF1P21359 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NF1P21359 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NF1P21359 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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