Protein–RNA interactions for Protein: P16452

EPB42, Erythrocyte membrane protein band 4.2, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB42P16452 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EPB42P16452 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EPB42P16452 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EPB42P16452 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EPB42P16452 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EPB42P16452 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EPB42P16452 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EPB42P16452 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EPB42P16452 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EPB42P16452 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
EPB42P16452 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EPB42P16452 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
EPB42P16452 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
EPB42P16452 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EPB42P16452 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EPB42P16452 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EPB42P16452 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EPB42P16452 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EPB42P16452 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EPB42P16452 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EPB42P16452 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EPB42P16452 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EPB42P16452 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EPB42P16452 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EPB42P16452 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EPB42P16452 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EPB42P16452 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EPB42P16452 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EPB42P16452 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EPB42P16452 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EPB42P16452 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EPB42P16452 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EPB42P16452 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EPB42P16452 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EPB42P16452 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EPB42P16452 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EPB42P16452 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EPB42P16452 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EPB42P16452 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EPB42P16452 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EPB42P16452 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EPB42P16452 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
EPB42P16452 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EPB42P16452 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EPB42P16452 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
EPB42P16452 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EPB42P16452 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EPB42P16452 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EPB42P16452 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EPB42P16452 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EPB42P16452 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EPB42P16452 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EPB42P16452 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EPB42P16452 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EPB42P16452 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
EPB42P16452 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
EPB42P16452 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EPB42P16452 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EPB42P16452 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EPB42P16452 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EPB42P16452 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EPB42P16452 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EPB42P16452 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EPB42P16452 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EPB42P16452 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EPB42P16452 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EPB42P16452 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EPB42P16452 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EPB42P16452 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EPB42P16452 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EPB42P16452 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EPB42P16452 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EPB42P16452 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EPB42P16452 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EPB42P16452 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EPB42P16452 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EPB42P16452 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EPB42P16452 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EPB42P16452 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
EPB42P16452 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EPB42P16452 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EPB42P16452 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EPB42P16452 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EPB42P16452 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EPB42P16452 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EPB42P16452 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EPB42P16452 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EPB42P16452 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EPB42P16452 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EPB42P16452 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EPB42P16452 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EPB42P16452 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
EPB42P16452 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EPB42P16452 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
EPB42P16452 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EPB42P16452 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EPB42P16452 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EPB42P16452 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EPB42P16452 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EPB42P16452 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms