Protein–RNA interactions for Protein: P11230

CHRNB1, Acetylcholine receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB1P11230 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHRNB1P11230 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CHRNB1P11230 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHRNB1P11230 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHRNB1P11230 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHRNB1P11230 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHRNB1P11230 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHRNB1P11230 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHRNB1P11230 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHRNB1P11230 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHRNB1P11230 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHRNB1P11230 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHRNB1P11230 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHRNB1P11230 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHRNB1P11230 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CHRNB1P11230 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHRNB1P11230 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHRNB1P11230 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHRNB1P11230 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHRNB1P11230 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHRNB1P11230 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHRNB1P11230 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHRNB1P11230 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHRNB1P11230 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHRNB1P11230 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHRNB1P11230 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHRNB1P11230 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHRNB1P11230 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHRNB1P11230 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHRNB1P11230 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHRNB1P11230 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHRNB1P11230 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHRNB1P11230 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHRNB1P11230 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHRNB1P11230 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHRNB1P11230 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHRNB1P11230 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CHRNB1P11230 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHRNB1P11230 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHRNB1P11230 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHRNB1P11230 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHRNB1P11230 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHRNB1P11230 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHRNB1P11230 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHRNB1P11230 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CHRNB1P11230 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHRNB1P11230 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CHRNB1P11230 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHRNB1P11230 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHRNB1P11230 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHRNB1P11230 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHRNB1P11230 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHRNB1P11230 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHRNB1P11230 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHRNB1P11230 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHRNB1P11230 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHRNB1P11230 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHRNB1P11230 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHRNB1P11230 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CHRNB1P11230 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHRNB1P11230 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHRNB1P11230 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHRNB1P11230 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHRNB1P11230 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHRNB1P11230 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHRNB1P11230 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHRNB1P11230 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHRNB1P11230 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHRNB1P11230 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHRNB1P11230 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHRNB1P11230 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHRNB1P11230 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHRNB1P11230 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHRNB1P11230 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHRNB1P11230 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CHRNB1P11230 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHRNB1P11230 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHRNB1P11230 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHRNB1P11230 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHRNB1P11230 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHRNB1P11230 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CHRNB1P11230 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.89■□□□□ 0.62
CHRNB1P11230 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CHRNB1P11230 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
CHRNB1P11230 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CHRNB1P11230 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CHRNB1P11230 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CHRNB1P11230 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHRNB1P11230 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHRNB1P11230 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHRNB1P11230 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHRNB1P11230 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CHRNB1P11230 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHRNB1P11230 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHRNB1P11230 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHRNB1P11230 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHRNB1P11230 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHRNB1P11230 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHRNB1P11230 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CHRNB1P11230 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms