Protein–RNA interactions for Protein: P10911

MCF2, Proto-oncogene DBL, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCF2P10911 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MCF2P10911 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MCF2P10911 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MCF2P10911 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
MCF2P10911 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
MCF2P10911 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
MCF2P10911 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MCF2P10911 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MCF2P10911 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MCF2P10911 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MCF2P10911 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MCF2P10911 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MCF2P10911 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
MCF2P10911 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MCF2P10911 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MCF2P10911 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MCF2P10911 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MCF2P10911 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MCF2P10911 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MCF2P10911 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MCF2P10911 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MCF2P10911 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MCF2P10911 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MCF2P10911 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MCF2P10911 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MCF2P10911 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MCF2P10911 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MCF2P10911 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MCF2P10911 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MCF2P10911 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MCF2P10911 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MCF2P10911 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MCF2P10911 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
MCF2P10911 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
MCF2P10911 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MCF2P10911 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MCF2P10911 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MCF2P10911 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
MCF2P10911 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MCF2P10911 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MCF2P10911 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
MCF2P10911 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MCF2P10911 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MCF2P10911 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MCF2P10911 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MCF2P10911 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MCF2P10911 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MCF2P10911 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MCF2P10911 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MCF2P10911 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MCF2P10911 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MCF2P10911 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MCF2P10911 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MCF2P10911 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MCF2P10911 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MCF2P10911 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MCF2P10911 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MCF2P10911 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MCF2P10911 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MCF2P10911 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MCF2P10911 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
MCF2P10911 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MCF2P10911 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MCF2P10911 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MCF2P10911 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MCF2P10911 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MCF2P10911 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MCF2P10911 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MCF2P10911 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MCF2P10911 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MCF2P10911 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MCF2P10911 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MCF2P10911 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MCF2P10911 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MCF2P10911 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
MCF2P10911 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MCF2P10911 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MCF2P10911 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MCF2P10911 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MCF2P10911 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MCF2P10911 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MCF2P10911 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MCF2P10911 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MCF2P10911 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MCF2P10911 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MCF2P10911 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
MCF2P10911 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MCF2P10911 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MCF2P10911 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
MCF2P10911 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MCF2P10911 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MCF2P10911 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MCF2P10911 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MCF2P10911 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MCF2P10911 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MCF2P10911 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MCF2P10911 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MCF2P10911 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MCF2P10911 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MCF2P10911 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms