Protein–RNA interactions for Protein: P05386

RPLP1, 60S acidic ribosomal protein P1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPLP1P05386 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPLP1P05386 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPLP1P05386 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RPLP1P05386 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RPLP1P05386 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPLP1P05386 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPLP1P05386 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
RPLP1P05386 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
RPLP1P05386 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RPLP1P05386 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RPLP1P05386 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
RPLP1P05386 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RPLP1P05386 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RPLP1P05386 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
RPLP1P05386 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RPLP1P05386 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
RPLP1P05386 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RPLP1P05386 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RPLP1P05386 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RPLP1P05386 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RPLP1P05386 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RPLP1P05386 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RPLP1P05386 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
RPLP1P05386 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RPLP1P05386 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RPLP1P05386 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RPLP1P05386 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RPLP1P05386 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RPLP1P05386 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RPLP1P05386 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
RPLP1P05386 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
RPLP1P05386 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RPLP1P05386 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RPLP1P05386 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
RPLP1P05386 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RPLP1P05386 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RPLP1P05386 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RPLP1P05386 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RPLP1P05386 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RPLP1P05386 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RPLP1P05386 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RPLP1P05386 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RPLP1P05386 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RPLP1P05386 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
RPLP1P05386 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RPLP1P05386 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RPLP1P05386 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RPLP1P05386 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RPLP1P05386 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RPLP1P05386 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RPLP1P05386 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RPLP1P05386 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RPLP1P05386 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RPLP1P05386 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RPLP1P05386 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RPLP1P05386 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RPLP1P05386 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RPLP1P05386 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RPLP1P05386 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RPLP1P05386 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RPLP1P05386 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RPLP1P05386 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RPLP1P05386 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RPLP1P05386 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RPLP1P05386 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPLP1P05386 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPLP1P05386 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPLP1P05386 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPLP1P05386 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RPLP1P05386 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPLP1P05386 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPLP1P05386 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPLP1P05386 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPLP1P05386 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPLP1P05386 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPLP1P05386 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPLP1P05386 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPLP1P05386 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RPLP1P05386 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPLP1P05386 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RPLP1P05386 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RPLP1P05386 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RPLP1P05386 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RPLP1P05386 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPLP1P05386 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPLP1P05386 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPLP1P05386 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPLP1P05386 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPLP1P05386 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPLP1P05386 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RPLP1P05386 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RPLP1P05386 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPLP1P05386 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPLP1P05386 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
RPLP1P05386 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RPLP1P05386 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RPLP1P05386 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RPLP1P05386 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RPLP1P05386 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RPLP1P05386 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms