Protein–RNA interactions for Protein: O60486

PLXNC1, Plexin-C1, humanhuman

Predictions only

Length 1,568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNC1O60486 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PLXNC1O60486 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PLXNC1O60486 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PLXNC1O60486 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PLXNC1O60486 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PLXNC1O60486 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PLXNC1O60486 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PLXNC1O60486 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PLXNC1O60486 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PLXNC1O60486 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PLXNC1O60486 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PLXNC1O60486 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PLXNC1O60486 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PLXNC1O60486 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PLXNC1O60486 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PLXNC1O60486 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PLXNC1O60486 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PLXNC1O60486 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PLXNC1O60486 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PLXNC1O60486 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PLXNC1O60486 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
PLXNC1O60486 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PLXNC1O60486 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PLXNC1O60486 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PLXNC1O60486 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PLXNC1O60486 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PLXNC1O60486 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PLXNC1O60486 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PLXNC1O60486 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PLXNC1O60486 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
PLXNC1O60486 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.03
PLXNC1O60486 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
PLXNC1O60486 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
PLXNC1O60486 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
PLXNC1O60486 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
PLXNC1O60486 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PLXNC1O60486 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PLXNC1O60486 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PLXNC1O60486 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PLXNC1O60486 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PLXNC1O60486 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PLXNC1O60486 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PLXNC1O60486 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PLXNC1O60486 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PLXNC1O60486 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PLXNC1O60486 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PLXNC1O60486 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PLXNC1O60486 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PLXNC1O60486 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PLXNC1O60486 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PLXNC1O60486 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PLXNC1O60486 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PLXNC1O60486 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PLXNC1O60486 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
PLXNC1O60486 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PLXNC1O60486 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PLXNC1O60486 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
PLXNC1O60486 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PLXNC1O60486 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PLXNC1O60486 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PLXNC1O60486 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PLXNC1O60486 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PLXNC1O60486 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PLXNC1O60486 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PLXNC1O60486 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PLXNC1O60486 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PLXNC1O60486 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PLXNC1O60486 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PLXNC1O60486 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PLXNC1O60486 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PLXNC1O60486 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PLXNC1O60486 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PLXNC1O60486 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PLXNC1O60486 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PLXNC1O60486 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PLXNC1O60486 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PLXNC1O60486 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PLXNC1O60486 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PLXNC1O60486 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
PLXNC1O60486 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PLXNC1O60486 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PLXNC1O60486 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PLXNC1O60486 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PLXNC1O60486 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PLXNC1O60486 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PLXNC1O60486 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PLXNC1O60486 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PLXNC1O60486 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PLXNC1O60486 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PLXNC1O60486 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PLXNC1O60486 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
PLXNC1O60486 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PLXNC1O60486 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PLXNC1O60486 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PLXNC1O60486 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PLXNC1O60486 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PLXNC1O60486 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PLXNC1O60486 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PLXNC1O60486 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PLXNC1O60486 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms