Protein–RNA interactions for Protein: O60449

LY75, Lymphocyte antigen 75, humanhuman

Predictions only

Length 1,722 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LY75O60449 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LY75O60449 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
LY75O60449 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
LY75O60449 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
LY75O60449 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LY75O60449 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LY75O60449 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LY75O60449 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LY75O60449 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LY75O60449 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LY75O60449 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LY75O60449 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LY75O60449 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LY75O60449 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LY75O60449 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LY75O60449 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LY75O60449 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LY75O60449 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
LY75O60449 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LY75O60449 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
LY75O60449 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LY75O60449 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
LY75O60449 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LY75O60449 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LY75O60449 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LY75O60449 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LY75O60449 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LY75O60449 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LY75O60449 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LY75O60449 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LY75O60449 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LY75O60449 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LY75O60449 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LY75O60449 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LY75O60449 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
LY75O60449 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
LY75O60449 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LY75O60449 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LY75O60449 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LY75O60449 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
LY75O60449 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LY75O60449 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LY75O60449 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LY75O60449 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LY75O60449 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LY75O60449 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
LY75O60449 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.38
LY75O60449 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
LY75O60449 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LY75O60449 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LY75O60449 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LY75O60449 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
LY75O60449 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LY75O60449 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
LY75O60449 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LY75O60449 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LY75O60449 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LY75O60449 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LY75O60449 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LY75O60449 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LY75O60449 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LY75O60449 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LY75O60449 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LY75O60449 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LY75O60449 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LY75O60449 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
LY75O60449 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LY75O60449 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LY75O60449 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LY75O60449 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LY75O60449 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LY75O60449 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LY75O60449 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LY75O60449 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LY75O60449 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LY75O60449 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
LY75O60449 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LY75O60449 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LY75O60449 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
LY75O60449 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
LY75O60449 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LY75O60449 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
LY75O60449 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LY75O60449 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LY75O60449 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LY75O60449 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LY75O60449 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LY75O60449 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LY75O60449 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LY75O60449 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LY75O60449 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
LY75O60449 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LY75O60449 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LY75O60449 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LY75O60449 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LY75O60449 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LY75O60449 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
LY75O60449 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LY75O60449 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LY75O60449 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms