Protein–RNA interactions for Protein: O43741

PRKAB2, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAB2O43741 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRKAB2O43741 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRKAB2O43741 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRKAB2O43741 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRKAB2O43741 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PRKAB2O43741 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
PRKAB2O43741 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
PRKAB2O43741 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRKAB2O43741 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRKAB2O43741 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRKAB2O43741 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRKAB2O43741 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRKAB2O43741 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRKAB2O43741 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRKAB2O43741 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PRKAB2O43741 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRKAB2O43741 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRKAB2O43741 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PRKAB2O43741 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRKAB2O43741 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRKAB2O43741 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRKAB2O43741 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRKAB2O43741 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRKAB2O43741 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRKAB2O43741 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRKAB2O43741 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRKAB2O43741 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRKAB2O43741 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRKAB2O43741 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRKAB2O43741 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRKAB2O43741 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRKAB2O43741 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRKAB2O43741 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRKAB2O43741 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRKAB2O43741 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRKAB2O43741 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRKAB2O43741 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRKAB2O43741 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRKAB2O43741 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRKAB2O43741 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PRKAB2O43741 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PRKAB2O43741 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PRKAB2O43741 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PRKAB2O43741 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRKAB2O43741 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRKAB2O43741 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRKAB2O43741 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRKAB2O43741 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRKAB2O43741 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRKAB2O43741 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRKAB2O43741 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRKAB2O43741 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRKAB2O43741 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRKAB2O43741 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRKAB2O43741 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRKAB2O43741 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRKAB2O43741 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRKAB2O43741 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRKAB2O43741 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRKAB2O43741 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PRKAB2O43741 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PRKAB2O43741 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRKAB2O43741 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRKAB2O43741 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKAB2O43741 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKAB2O43741 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKAB2O43741 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKAB2O43741 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKAB2O43741 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKAB2O43741 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKAB2O43741 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKAB2O43741 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKAB2O43741 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKAB2O43741 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKAB2O43741 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKAB2O43741 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKAB2O43741 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKAB2O43741 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKAB2O43741 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKAB2O43741 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKAB2O43741 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKAB2O43741 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKAB2O43741 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKAB2O43741 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKAB2O43741 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKAB2O43741 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKAB2O43741 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKAB2O43741 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKAB2O43741 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKAB2O43741 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKAB2O43741 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKAB2O43741 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKAB2O43741 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKAB2O43741 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKAB2O43741 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKAB2O43741 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKAB2O43741 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKAB2O43741 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKAB2O43741 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKAB2O43741 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms