Protein–RNA interactions for Protein: O43525

KCNQ3, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 3, humanhuman

Predictions only

Length 872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ3O43525 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
KCNQ3O43525 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
KCNQ3O43525 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KCNQ3O43525 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KCNQ3O43525 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KCNQ3O43525 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
KCNQ3O43525 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
KCNQ3O43525 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
KCNQ3O43525 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
KCNQ3O43525 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KCNQ3O43525 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KCNQ3O43525 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KCNQ3O43525 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KCNQ3O43525 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KCNQ3O43525 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KCNQ3O43525 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KCNQ3O43525 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KCNQ3O43525 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KCNQ3O43525 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KCNQ3O43525 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KCNQ3O43525 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KCNQ3O43525 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KCNQ3O43525 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
KCNQ3O43525 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KCNQ3O43525 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KCNQ3O43525 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KCNQ3O43525 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KCNQ3O43525 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KCNQ3O43525 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KCNQ3O43525 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KCNQ3O43525 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KCNQ3O43525 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KCNQ3O43525 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KCNQ3O43525 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KCNQ3O43525 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KCNQ3O43525 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
KCNQ3O43525 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KCNQ3O43525 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KCNQ3O43525 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KCNQ3O43525 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KCNQ3O43525 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KCNQ3O43525 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KCNQ3O43525 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KCNQ3O43525 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KCNQ3O43525 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KCNQ3O43525 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KCNQ3O43525 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KCNQ3O43525 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KCNQ3O43525 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KCNQ3O43525 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
KCNQ3O43525 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KCNQ3O43525 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KCNQ3O43525 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KCNQ3O43525 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KCNQ3O43525 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KCNQ3O43525 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KCNQ3O43525 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KCNQ3O43525 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KCNQ3O43525 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KCNQ3O43525 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KCNQ3O43525 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KCNQ3O43525 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KCNQ3O43525 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KCNQ3O43525 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KCNQ3O43525 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KCNQ3O43525 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KCNQ3O43525 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KCNQ3O43525 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KCNQ3O43525 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KCNQ3O43525 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KCNQ3O43525 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KCNQ3O43525 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KCNQ3O43525 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KCNQ3O43525 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KCNQ3O43525 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
KCNQ3O43525 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KCNQ3O43525 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KCNQ3O43525 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KCNQ3O43525 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KCNQ3O43525 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KCNQ3O43525 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KCNQ3O43525 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KCNQ3O43525 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KCNQ3O43525 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KCNQ3O43525 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KCNQ3O43525 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KCNQ3O43525 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KCNQ3O43525 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KCNQ3O43525 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KCNQ3O43525 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KCNQ3O43525 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KCNQ3O43525 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KCNQ3O43525 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
KCNQ3O43525 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KCNQ3O43525 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KCNQ3O43525 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KCNQ3O43525 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KCNQ3O43525 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KCNQ3O43525 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KCNQ3O43525 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms