Protein–RNA interactions for Protein: O43295

SRGAP3, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,099 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP3O43295 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SRGAP3O43295 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SRGAP3O43295 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SRGAP3O43295 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SRGAP3O43295 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SRGAP3O43295 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SRGAP3O43295 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SRGAP3O43295 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SRGAP3O43295 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SRGAP3O43295 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SRGAP3O43295 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SRGAP3O43295 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SRGAP3O43295 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SRGAP3O43295 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SRGAP3O43295 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SRGAP3O43295 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SRGAP3O43295 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SRGAP3O43295 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SRGAP3O43295 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SRGAP3O43295 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SRGAP3O43295 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SRGAP3O43295 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SRGAP3O43295 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SRGAP3O43295 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SRGAP3O43295 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SRGAP3O43295 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SRGAP3O43295 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SRGAP3O43295 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SRGAP3O43295 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SRGAP3O43295 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SRGAP3O43295 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SRGAP3O43295 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SRGAP3O43295 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SRGAP3O43295 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SRGAP3O43295 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SRGAP3O43295 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SRGAP3O43295 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SRGAP3O43295 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SRGAP3O43295 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SRGAP3O43295 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SRGAP3O43295 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SRGAP3O43295 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SRGAP3O43295 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SRGAP3O43295 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SRGAP3O43295 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SRGAP3O43295 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SRGAP3O43295 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SRGAP3O43295 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SRGAP3O43295 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SRGAP3O43295 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SRGAP3O43295 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SRGAP3O43295 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SRGAP3O43295 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SRGAP3O43295 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SRGAP3O43295 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SRGAP3O43295 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SRGAP3O43295 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SRGAP3O43295 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SRGAP3O43295 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SRGAP3O43295 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SRGAP3O43295 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SRGAP3O43295 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SRGAP3O43295 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SRGAP3O43295 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SRGAP3O43295 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SRGAP3O43295 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SRGAP3O43295 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SRGAP3O43295 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SRGAP3O43295 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SRGAP3O43295 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SRGAP3O43295 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SRGAP3O43295 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SRGAP3O43295 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SRGAP3O43295 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SRGAP3O43295 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SRGAP3O43295 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SRGAP3O43295 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SRGAP3O43295 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SRGAP3O43295 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SRGAP3O43295 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SRGAP3O43295 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SRGAP3O43295 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SRGAP3O43295 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SRGAP3O43295 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SRGAP3O43295 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SRGAP3O43295 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SRGAP3O43295 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SRGAP3O43295 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SRGAP3O43295 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SRGAP3O43295 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SRGAP3O43295 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SRGAP3O43295 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SRGAP3O43295 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SRGAP3O43295 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SRGAP3O43295 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SRGAP3O43295 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SRGAP3O43295 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SRGAP3O43295 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SRGAP3O43295 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SRGAP3O43295 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms