Protein–RNA interactions for Protein: O00411

POLRMT, DNA-directed RNA polymerase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLRMTO00411 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLRMTO00411 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLRMTO00411 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLRMTO00411 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLRMTO00411 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLRMTO00411 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLRMTO00411 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLRMTO00411 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLRMTO00411 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLRMTO00411 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLRMTO00411 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLRMTO00411 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLRMTO00411 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
POLRMTO00411 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
POLRMTO00411 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
POLRMTO00411 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLRMTO00411 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
POLRMTO00411 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLRMTO00411 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLRMTO00411 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLRMTO00411 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLRMTO00411 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLRMTO00411 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLRMTO00411 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLRMTO00411 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLRMTO00411 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLRMTO00411 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLRMTO00411 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLRMTO00411 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLRMTO00411 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLRMTO00411 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLRMTO00411 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLRMTO00411 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLRMTO00411 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLRMTO00411 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLRMTO00411 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLRMTO00411 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLRMTO00411 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLRMTO00411 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
POLRMTO00411 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
POLRMTO00411 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLRMTO00411 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLRMTO00411 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLRMTO00411 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLRMTO00411 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
POLRMTO00411 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
POLRMTO00411 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLRMTO00411 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLRMTO00411 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLRMTO00411 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLRMTO00411 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLRMTO00411 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLRMTO00411 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLRMTO00411 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLRMTO00411 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLRMTO00411 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLRMTO00411 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLRMTO00411 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLRMTO00411 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
POLRMTO00411 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLRMTO00411 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
POLRMTO00411 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLRMTO00411 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
POLRMTO00411 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLRMTO00411 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLRMTO00411 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLRMTO00411 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLRMTO00411 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLRMTO00411 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLRMTO00411 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLRMTO00411 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLRMTO00411 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLRMTO00411 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLRMTO00411 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
POLRMTO00411 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
POLRMTO00411 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLRMTO00411 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLRMTO00411 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLRMTO00411 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLRMTO00411 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLRMTO00411 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLRMTO00411 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLRMTO00411 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLRMTO00411 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLRMTO00411 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLRMTO00411 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLRMTO00411 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLRMTO00411 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLRMTO00411 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLRMTO00411 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLRMTO00411 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLRMTO00411 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLRMTO00411 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLRMTO00411 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLRMTO00411 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLRMTO00411 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
POLRMTO00411 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLRMTO00411 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLRMTO00411 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLRMTO00411 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms