Protein–RNA interactions for Protein: O00193

SMAP, Small acidic protein, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAPO00193 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMAPO00193 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMAPO00193 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMAPO00193 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMAPO00193 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMAPO00193 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMAPO00193 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMAPO00193 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMAPO00193 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMAPO00193 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMAPO00193 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMAPO00193 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMAPO00193 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMAPO00193 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMAPO00193 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SMAPO00193 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SMAPO00193 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMAPO00193 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMAPO00193 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SMAPO00193 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SMAPO00193 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMAPO00193 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMAPO00193 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMAPO00193 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMAPO00193 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMAPO00193 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMAPO00193 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMAPO00193 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMAPO00193 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMAPO00193 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMAPO00193 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMAPO00193 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMAPO00193 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMAPO00193 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SMAPO00193 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
SMAPO00193 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SMAPO00193 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SMAPO00193 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SMAPO00193 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SMAPO00193 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SMAPO00193 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SMAPO00193 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SMAPO00193 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SMAPO00193 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SMAPO00193 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SMAPO00193 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SMAPO00193 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SMAPO00193 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SMAPO00193 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SMAPO00193 AC244517.3-201ENST00000616254 1235 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SMAPO00193 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SMAPO00193 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SMAPO00193 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SMAPO00193 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SMAPO00193 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SMAPO00193 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SMAPO00193 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SMAPO00193 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SMAPO00193 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SMAPO00193 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SMAPO00193 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SMAPO00193 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SMAPO00193 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SMAPO00193 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SMAPO00193 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SMAPO00193 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SMAPO00193 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SMAPO00193 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMAPO00193 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMAPO00193 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMAPO00193 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMAPO00193 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SMAPO00193 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMAPO00193 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMAPO00193 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMAPO00193 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMAPO00193 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMAPO00193 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMAPO00193 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMAPO00193 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMAPO00193 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMAPO00193 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMAPO00193 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMAPO00193 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMAPO00193 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMAPO00193 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMAPO00193 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMAPO00193 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SMAPO00193 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SMAPO00193 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMAPO00193 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMAPO00193 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMAPO00193 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMAPO00193 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SMAPO00193 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SMAPO00193 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMAPO00193 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMAPO00193 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMAPO00193 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMAPO00193 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
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