Protein–RNA interactions for Protein: O00161

SNAP23, Synaptosomal-associated protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP23O00161 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNAP23O00161 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNAP23O00161 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNAP23O00161 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNAP23O00161 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNAP23O00161 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNAP23O00161 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNAP23O00161 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNAP23O00161 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SNAP23O00161 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNAP23O00161 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SNAP23O00161 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNAP23O00161 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SNAP23O00161 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNAP23O00161 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNAP23O00161 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNAP23O00161 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNAP23O00161 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNAP23O00161 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNAP23O00161 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNAP23O00161 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNAP23O00161 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNAP23O00161 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNAP23O00161 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNAP23O00161 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNAP23O00161 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SNAP23O00161 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNAP23O00161 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNAP23O00161 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNAP23O00161 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNAP23O00161 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNAP23O00161 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNAP23O00161 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNAP23O00161 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SNAP23O00161 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNAP23O00161 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNAP23O00161 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SNAP23O00161 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNAP23O00161 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNAP23O00161 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNAP23O00161 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNAP23O00161 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNAP23O00161 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNAP23O00161 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNAP23O00161 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNAP23O00161 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNAP23O00161 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNAP23O00161 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNAP23O00161 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNAP23O00161 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNAP23O00161 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNAP23O00161 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNAP23O00161 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNAP23O00161 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNAP23O00161 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNAP23O00161 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNAP23O00161 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SNAP23O00161 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SNAP23O00161 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SNAP23O00161 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNAP23O00161 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNAP23O00161 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNAP23O00161 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SNAP23O00161 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNAP23O00161 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNAP23O00161 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNAP23O00161 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNAP23O00161 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNAP23O00161 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNAP23O00161 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNAP23O00161 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SNAP23O00161 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNAP23O00161 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNAP23O00161 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SNAP23O00161 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNAP23O00161 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNAP23O00161 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNAP23O00161 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNAP23O00161 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SNAP23O00161 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNAP23O00161 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNAP23O00161 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNAP23O00161 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNAP23O00161 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNAP23O00161 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SNAP23O00161 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNAP23O00161 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNAP23O00161 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNAP23O00161 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNAP23O00161 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNAP23O00161 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNAP23O00161 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNAP23O00161 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNAP23O00161 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNAP23O00161 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNAP23O00161 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNAP23O00161 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNAP23O00161 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNAP23O00161 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SNAP23O00161 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms