Protein–RNA interactions for Protein: A6NMT0

DBX1, Homeobox protein DBX1, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DBX1A6NMT0 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DBX1A6NMT0 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DBX1A6NMT0 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DBX1A6NMT0 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DBX1A6NMT0 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DBX1A6NMT0 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DBX1A6NMT0 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DBX1A6NMT0 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DBX1A6NMT0 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DBX1A6NMT0 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DBX1A6NMT0 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DBX1A6NMT0 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DBX1A6NMT0 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DBX1A6NMT0 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DBX1A6NMT0 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DBX1A6NMT0 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DBX1A6NMT0 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DBX1A6NMT0 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
DBX1A6NMT0 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DBX1A6NMT0 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DBX1A6NMT0 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DBX1A6NMT0 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DBX1A6NMT0 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DBX1A6NMT0 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DBX1A6NMT0 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DBX1A6NMT0 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DBX1A6NMT0 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
DBX1A6NMT0 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
DBX1A6NMT0 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DBX1A6NMT0 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
DBX1A6NMT0 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DBX1A6NMT0 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DBX1A6NMT0 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DBX1A6NMT0 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DBX1A6NMT0 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DBX1A6NMT0 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DBX1A6NMT0 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DBX1A6NMT0 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DBX1A6NMT0 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DBX1A6NMT0 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
DBX1A6NMT0 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DBX1A6NMT0 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DBX1A6NMT0 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DBX1A6NMT0 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DBX1A6NMT0 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DBX1A6NMT0 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DBX1A6NMT0 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DBX1A6NMT0 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DBX1A6NMT0 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DBX1A6NMT0 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DBX1A6NMT0 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DBX1A6NMT0 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DBX1A6NMT0 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DBX1A6NMT0 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DBX1A6NMT0 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DBX1A6NMT0 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DBX1A6NMT0 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DBX1A6NMT0 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DBX1A6NMT0 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DBX1A6NMT0 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DBX1A6NMT0 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DBX1A6NMT0 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DBX1A6NMT0 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DBX1A6NMT0 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DBX1A6NMT0 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DBX1A6NMT0 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DBX1A6NMT0 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DBX1A6NMT0 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DBX1A6NMT0 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DBX1A6NMT0 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DBX1A6NMT0 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DBX1A6NMT0 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DBX1A6NMT0 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DBX1A6NMT0 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DBX1A6NMT0 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DBX1A6NMT0 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DBX1A6NMT0 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DBX1A6NMT0 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DBX1A6NMT0 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DBX1A6NMT0 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
DBX1A6NMT0 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DBX1A6NMT0 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DBX1A6NMT0 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DBX1A6NMT0 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DBX1A6NMT0 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
DBX1A6NMT0 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
DBX1A6NMT0 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
DBX1A6NMT0 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
DBX1A6NMT0 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
DBX1A6NMT0 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
DBX1A6NMT0 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
DBX1A6NMT0 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
DBX1A6NMT0 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DBX1A6NMT0 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DBX1A6NMT0 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DBX1A6NMT0 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DBX1A6NMT0 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DBX1A6NMT0 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
DBX1A6NMT0 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DBX1A6NMT0 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms