Protein–RNA interactions for Protein: A6NKG5

RTL1, Retrotransposon-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL1A6NKG5 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RTL1A6NKG5 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RTL1A6NKG5 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RTL1A6NKG5 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RTL1A6NKG5 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RTL1A6NKG5 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RTL1A6NKG5 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
RTL1A6NKG5 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RTL1A6NKG5 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RTL1A6NKG5 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
RTL1A6NKG5 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RTL1A6NKG5 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RTL1A6NKG5 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RTL1A6NKG5 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RTL1A6NKG5 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.56
RTL1A6NKG5 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RTL1A6NKG5 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RTL1A6NKG5 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RTL1A6NKG5 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RTL1A6NKG5 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RTL1A6NKG5 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RTL1A6NKG5 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RTL1A6NKG5 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RTL1A6NKG5 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RTL1A6NKG5 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RTL1A6NKG5 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RTL1A6NKG5 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RTL1A6NKG5 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RTL1A6NKG5 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RTL1A6NKG5 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RTL1A6NKG5 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RTL1A6NKG5 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RTL1A6NKG5 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
RTL1A6NKG5 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
RTL1A6NKG5 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RTL1A6NKG5 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RTL1A6NKG5 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RTL1A6NKG5 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RTL1A6NKG5 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RTL1A6NKG5 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RTL1A6NKG5 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RTL1A6NKG5 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RTL1A6NKG5 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RTL1A6NKG5 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RTL1A6NKG5 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
RTL1A6NKG5 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
RTL1A6NKG5 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RTL1A6NKG5 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RTL1A6NKG5 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RTL1A6NKG5 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RTL1A6NKG5 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RTL1A6NKG5 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RTL1A6NKG5 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RTL1A6NKG5 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RTL1A6NKG5 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RTL1A6NKG5 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RTL1A6NKG5 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RTL1A6NKG5 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
RTL1A6NKG5 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RTL1A6NKG5 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RTL1A6NKG5 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RTL1A6NKG5 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RTL1A6NKG5 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RTL1A6NKG5 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
RTL1A6NKG5 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RTL1A6NKG5 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RTL1A6NKG5 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RTL1A6NKG5 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RTL1A6NKG5 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RTL1A6NKG5 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RTL1A6NKG5 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RTL1A6NKG5 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RTL1A6NKG5 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RTL1A6NKG5 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RTL1A6NKG5 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
RTL1A6NKG5 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
RTL1A6NKG5 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RTL1A6NKG5 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RTL1A6NKG5 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RTL1A6NKG5 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RTL1A6NKG5 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
RTL1A6NKG5 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RTL1A6NKG5 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RTL1A6NKG5 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RTL1A6NKG5 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
RTL1A6NKG5 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RTL1A6NKG5 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RTL1A6NKG5 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RTL1A6NKG5 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RTL1A6NKG5 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RTL1A6NKG5 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RTL1A6NKG5 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RTL1A6NKG5 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RTL1A6NKG5 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RTL1A6NKG5 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RTL1A6NKG5 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RTL1A6NKG5 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RTL1A6NKG5 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RTL1A6NKG5 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RTL1A6NKG5 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms