Protein–RNA interactions for Protein: A6NCQ9

RNF222, RING finger protein 222, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF222A6NCQ9 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RNF222A6NCQ9 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RNF222A6NCQ9 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RNF222A6NCQ9 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RNF222A6NCQ9 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RNF222A6NCQ9 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RNF222A6NCQ9 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RNF222A6NCQ9 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RNF222A6NCQ9 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RNF222A6NCQ9 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RNF222A6NCQ9 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RNF222A6NCQ9 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RNF222A6NCQ9 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RNF222A6NCQ9 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RNF222A6NCQ9 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RNF222A6NCQ9 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RNF222A6NCQ9 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RNF222A6NCQ9 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RNF222A6NCQ9 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RNF222A6NCQ9 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF222A6NCQ9 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF222A6NCQ9 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF222A6NCQ9 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF222A6NCQ9 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF222A6NCQ9 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF222A6NCQ9 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF222A6NCQ9 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF222A6NCQ9 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF222A6NCQ9 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF222A6NCQ9 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF222A6NCQ9 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF222A6NCQ9 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF222A6NCQ9 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF222A6NCQ9 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF222A6NCQ9 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF222A6NCQ9 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF222A6NCQ9 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF222A6NCQ9 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF222A6NCQ9 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF222A6NCQ9 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF222A6NCQ9 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF222A6NCQ9 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF222A6NCQ9 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF222A6NCQ9 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF222A6NCQ9 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF222A6NCQ9 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF222A6NCQ9 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF222A6NCQ9 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF222A6NCQ9 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF222A6NCQ9 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF222A6NCQ9 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF222A6NCQ9 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF222A6NCQ9 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF222A6NCQ9 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF222A6NCQ9 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF222A6NCQ9 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF222A6NCQ9 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF222A6NCQ9 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF222A6NCQ9 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF222A6NCQ9 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF222A6NCQ9 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF222A6NCQ9 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF222A6NCQ9 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RNF222A6NCQ9 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RNF222A6NCQ9 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RNF222A6NCQ9 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RNF222A6NCQ9 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RNF222A6NCQ9 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RNF222A6NCQ9 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RNF222A6NCQ9 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RNF222A6NCQ9 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RNF222A6NCQ9 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RNF222A6NCQ9 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RNF222A6NCQ9 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RNF222A6NCQ9 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RNF222A6NCQ9 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RNF222A6NCQ9 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RNF222A6NCQ9 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RNF222A6NCQ9 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RNF222A6NCQ9 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RNF222A6NCQ9 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RNF222A6NCQ9 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RNF222A6NCQ9 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RNF222A6NCQ9 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RNF222A6NCQ9 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RNF222A6NCQ9 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RNF222A6NCQ9 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RNF222A6NCQ9 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RNF222A6NCQ9 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RNF222A6NCQ9 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RNF222A6NCQ9 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RNF222A6NCQ9 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RNF222A6NCQ9 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RNF222A6NCQ9 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RNF222A6NCQ9 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNF222A6NCQ9 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNF222A6NCQ9 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNF222A6NCQ9 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNF222A6NCQ9 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNF222A6NCQ9 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms