Protein–RNA interactions for Protein: A2RUR9

CCDC144A, Coiled-coil domain-containing protein 144A, humanhuman

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC144AA2RUR9 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC144AA2RUR9 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC144AA2RUR9 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC144AA2RUR9 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC144AA2RUR9 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC144AA2RUR9 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC144AA2RUR9 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC144AA2RUR9 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC144AA2RUR9 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC144AA2RUR9 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC144AA2RUR9 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC144AA2RUR9 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC144AA2RUR9 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC144AA2RUR9 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC144AA2RUR9 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC144AA2RUR9 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC144AA2RUR9 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC144AA2RUR9 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC144AA2RUR9 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC144AA2RUR9 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC144AA2RUR9 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC144AA2RUR9 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC144AA2RUR9 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC144AA2RUR9 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC144AA2RUR9 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC144AA2RUR9 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC144AA2RUR9 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC144AA2RUR9 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC144AA2RUR9 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC144AA2RUR9 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC144AA2RUR9 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC144AA2RUR9 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC144AA2RUR9 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC144AA2RUR9 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC144AA2RUR9 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC144AA2RUR9 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC144AA2RUR9 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC144AA2RUR9 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC144AA2RUR9 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC144AA2RUR9 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC144AA2RUR9 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC144AA2RUR9 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC144AA2RUR9 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC144AA2RUR9 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC144AA2RUR9 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC144AA2RUR9 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC144AA2RUR9 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC144AA2RUR9 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC144AA2RUR9 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC144AA2RUR9 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC144AA2RUR9 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC144AA2RUR9 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC144AA2RUR9 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC144AA2RUR9 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC144AA2RUR9 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC144AA2RUR9 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC144AA2RUR9 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC144AA2RUR9 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC144AA2RUR9 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC144AA2RUR9 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC144AA2RUR9 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC144AA2RUR9 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC144AA2RUR9 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC144AA2RUR9 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC144AA2RUR9 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC144AA2RUR9 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC144AA2RUR9 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC144AA2RUR9 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC144AA2RUR9 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC144AA2RUR9 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC144AA2RUR9 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC144AA2RUR9 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC144AA2RUR9 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC144AA2RUR9 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC144AA2RUR9 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC144AA2RUR9 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC144AA2RUR9 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC144AA2RUR9 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC144AA2RUR9 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC144AA2RUR9 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC144AA2RUR9 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC144AA2RUR9 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC144AA2RUR9 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC144AA2RUR9 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC144AA2RUR9 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC144AA2RUR9 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC144AA2RUR9 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC144AA2RUR9 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC144AA2RUR9 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC144AA2RUR9 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC144AA2RUR9 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC144AA2RUR9 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC144AA2RUR9 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC144AA2RUR9 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC144AA2RUR9 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC144AA2RUR9 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC144AA2RUR9 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC144AA2RUR9 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC144AA2RUR9 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC144AA2RUR9 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms