Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6D6

ARFGEF1, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,849 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGEF1Q9Y6D6 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARFGEF1Q9Y6D6 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ARFGEF1Q9Y6D6 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ARFGEF1Q9Y6D6 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARFGEF1Q9Y6D6 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARFGEF1Q9Y6D6 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARFGEF1Q9Y6D6 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ARFGEF1Q9Y6D6 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARFGEF1Q9Y6D6 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARFGEF1Q9Y6D6 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ARFGEF1Q9Y6D6 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARFGEF1Q9Y6D6 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARFGEF1Q9Y6D6 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARFGEF1Q9Y6D6 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARFGEF1Q9Y6D6 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARFGEF1Q9Y6D6 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ARFGEF1Q9Y6D6 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ARFGEF1Q9Y6D6 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ARFGEF1Q9Y6D6 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ARFGEF1Q9Y6D6 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ARFGEF1Q9Y6D6 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARFGEF1Q9Y6D6 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARFGEF1Q9Y6D6 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARFGEF1Q9Y6D6 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ARFGEF1Q9Y6D6 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARFGEF1Q9Y6D6 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARFGEF1Q9Y6D6 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARFGEF1Q9Y6D6 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARFGEF1Q9Y6D6 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ARFGEF1Q9Y6D6 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARFGEF1Q9Y6D6 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARFGEF1Q9Y6D6 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARFGEF1Q9Y6D6 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARFGEF1Q9Y6D6 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARFGEF1Q9Y6D6 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARFGEF1Q9Y6D6 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARFGEF1Q9Y6D6 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARFGEF1Q9Y6D6 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARFGEF1Q9Y6D6 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARFGEF1Q9Y6D6 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARFGEF1Q9Y6D6 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARFGEF1Q9Y6D6 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARFGEF1Q9Y6D6 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARFGEF1Q9Y6D6 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ARFGEF1Q9Y6D6 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARFGEF1Q9Y6D6 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARFGEF1Q9Y6D6 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARFGEF1Q9Y6D6 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARFGEF1Q9Y6D6 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARFGEF1Q9Y6D6 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARFGEF1Q9Y6D6 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARFGEF1Q9Y6D6 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARFGEF1Q9Y6D6 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARFGEF1Q9Y6D6 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ARFGEF1Q9Y6D6 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARFGEF1Q9Y6D6 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARFGEF1Q9Y6D6 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARFGEF1Q9Y6D6 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARFGEF1Q9Y6D6 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARFGEF1Q9Y6D6 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ARFGEF1Q9Y6D6 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARFGEF1Q9Y6D6 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ARFGEF1Q9Y6D6 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARFGEF1Q9Y6D6 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ARFGEF1Q9Y6D6 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARFGEF1Q9Y6D6 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARFGEF1Q9Y6D6 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARFGEF1Q9Y6D6 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARFGEF1Q9Y6D6 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARFGEF1Q9Y6D6 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARFGEF1Q9Y6D6 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARFGEF1Q9Y6D6 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARFGEF1Q9Y6D6 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARFGEF1Q9Y6D6 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARFGEF1Q9Y6D6 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARFGEF1Q9Y6D6 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARFGEF1Q9Y6D6 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARFGEF1Q9Y6D6 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARFGEF1Q9Y6D6 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARFGEF1Q9Y6D6 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARFGEF1Q9Y6D6 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARFGEF1Q9Y6D6 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARFGEF1Q9Y6D6 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARFGEF1Q9Y6D6 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARFGEF1Q9Y6D6 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARFGEF1Q9Y6D6 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ARFGEF1Q9Y6D6 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARFGEF1Q9Y6D6 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARFGEF1Q9Y6D6 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARFGEF1Q9Y6D6 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARFGEF1Q9Y6D6 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARFGEF1Q9Y6D6 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ARFGEF1Q9Y6D6 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARFGEF1Q9Y6D6 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARFGEF1Q9Y6D6 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARFGEF1Q9Y6D6 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARFGEF1Q9Y6D6 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARFGEF1Q9Y6D6 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARFGEF1Q9Y6D6 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARFGEF1Q9Y6D6 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms