Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4C0

NRXN3, Neurexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN3Q9Y4C0 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NRXN3Q9Y4C0 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NRXN3Q9Y4C0 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NRXN3Q9Y4C0 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NRXN3Q9Y4C0 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NRXN3Q9Y4C0 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
NRXN3Q9Y4C0 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NRXN3Q9Y4C0 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NRXN3Q9Y4C0 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
NRXN3Q9Y4C0 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NRXN3Q9Y4C0 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NRXN3Q9Y4C0 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NRXN3Q9Y4C0 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NRXN3Q9Y4C0 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NRXN3Q9Y4C0 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
NRXN3Q9Y4C0 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NRXN3Q9Y4C0 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NRXN3Q9Y4C0 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NRXN3Q9Y4C0 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NRXN3Q9Y4C0 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NRXN3Q9Y4C0 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NRXN3Q9Y4C0 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NRXN3Q9Y4C0 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NRXN3Q9Y4C0 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NRXN3Q9Y4C0 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NRXN3Q9Y4C0 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NRXN3Q9Y4C0 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NRXN3Q9Y4C0 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NRXN3Q9Y4C0 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NRXN3Q9Y4C0 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
NRXN3Q9Y4C0 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NRXN3Q9Y4C0 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NRXN3Q9Y4C0 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NRXN3Q9Y4C0 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
NRXN3Q9Y4C0 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
NRXN3Q9Y4C0 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
NRXN3Q9Y4C0 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
NRXN3Q9Y4C0 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
NRXN3Q9Y4C0 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NRXN3Q9Y4C0 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NRXN3Q9Y4C0 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NRXN3Q9Y4C0 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NRXN3Q9Y4C0 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
NRXN3Q9Y4C0 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NRXN3Q9Y4C0 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NRXN3Q9Y4C0 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NRXN3Q9Y4C0 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NRXN3Q9Y4C0 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NRXN3Q9Y4C0 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NRXN3Q9Y4C0 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NRXN3Q9Y4C0 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NRXN3Q9Y4C0 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NRXN3Q9Y4C0 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NRXN3Q9Y4C0 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NRXN3Q9Y4C0 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NRXN3Q9Y4C0 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
NRXN3Q9Y4C0 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NRXN3Q9Y4C0 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NRXN3Q9Y4C0 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NRXN3Q9Y4C0 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NRXN3Q9Y4C0 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NRXN3Q9Y4C0 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NRXN3Q9Y4C0 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NRXN3Q9Y4C0 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NRXN3Q9Y4C0 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NRXN3Q9Y4C0 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NRXN3Q9Y4C0 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NRXN3Q9Y4C0 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NRXN3Q9Y4C0 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NRXN3Q9Y4C0 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NRXN3Q9Y4C0 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NRXN3Q9Y4C0 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NRXN3Q9Y4C0 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NRXN3Q9Y4C0 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NRXN3Q9Y4C0 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NRXN3Q9Y4C0 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NRXN3Q9Y4C0 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
NRXN3Q9Y4C0 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NRXN3Q9Y4C0 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NRXN3Q9Y4C0 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NRXN3Q9Y4C0 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NRXN3Q9Y4C0 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NRXN3Q9Y4C0 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NRXN3Q9Y4C0 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NRXN3Q9Y4C0 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
NRXN3Q9Y4C0 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NRXN3Q9Y4C0 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NRXN3Q9Y4C0 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NRXN3Q9Y4C0 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NRXN3Q9Y4C0 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NRXN3Q9Y4C0 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NRXN3Q9Y4C0 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NRXN3Q9Y4C0 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NRXN3Q9Y4C0 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NRXN3Q9Y4C0 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NRXN3Q9Y4C0 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NRXN3Q9Y4C0 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NRXN3Q9Y4C0 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NRXN3Q9Y4C0 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NRXN3Q9Y4C0 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms