Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y266

NUDC, Nuclear migration protein nudC, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCQ9Y266 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NUDCQ9Y266 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NUDCQ9Y266 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NUDCQ9Y266 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NUDCQ9Y266 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NUDCQ9Y266 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NUDCQ9Y266 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NUDCQ9Y266 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NUDCQ9Y266 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NUDCQ9Y266 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NUDCQ9Y266 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NUDCQ9Y266 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NUDCQ9Y266 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NUDCQ9Y266 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NUDCQ9Y266 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NUDCQ9Y266 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NUDCQ9Y266 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
NUDCQ9Y266 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NUDCQ9Y266 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NUDCQ9Y266 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NUDCQ9Y266 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NUDCQ9Y266 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NUDCQ9Y266 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
NUDCQ9Y266 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
NUDCQ9Y266 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NUDCQ9Y266 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NUDCQ9Y266 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NUDCQ9Y266 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
NUDCQ9Y266 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NUDCQ9Y266 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NUDCQ9Y266 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NUDCQ9Y266 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NUDCQ9Y266 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NUDCQ9Y266 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NUDCQ9Y266 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NUDCQ9Y266 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NUDCQ9Y266 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NUDCQ9Y266 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NUDCQ9Y266 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NUDCQ9Y266 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NUDCQ9Y266 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NUDCQ9Y266 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NUDCQ9Y266 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NUDCQ9Y266 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NUDCQ9Y266 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NUDCQ9Y266 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NUDCQ9Y266 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NUDCQ9Y266 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NUDCQ9Y266 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NUDCQ9Y266 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NUDCQ9Y266 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NUDCQ9Y266 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NUDCQ9Y266 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NUDCQ9Y266 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NUDCQ9Y266 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NUDCQ9Y266 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NUDCQ9Y266 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NUDCQ9Y266 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NUDCQ9Y266 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NUDCQ9Y266 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NUDCQ9Y266 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NUDCQ9Y266 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NUDCQ9Y266 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NUDCQ9Y266 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NUDCQ9Y266 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NUDCQ9Y266 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NUDCQ9Y266 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NUDCQ9Y266 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NUDCQ9Y266 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NUDCQ9Y266 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NUDCQ9Y266 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NUDCQ9Y266 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NUDCQ9Y266 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NUDCQ9Y266 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NUDCQ9Y266 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NUDCQ9Y266 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NUDCQ9Y266 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NUDCQ9Y266 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NUDCQ9Y266 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NUDCQ9Y266 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NUDCQ9Y266 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
NUDCQ9Y266 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NUDCQ9Y266 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NUDCQ9Y266 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NUDCQ9Y266 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
NUDCQ9Y266 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NUDCQ9Y266 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NUDCQ9Y266 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
NUDCQ9Y266 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NUDCQ9Y266 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
NUDCQ9Y266 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NUDCQ9Y266 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NUDCQ9Y266 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NUDCQ9Y266 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NUDCQ9Y266 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NUDCQ9Y266 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NUDCQ9Y266 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NUDCQ9Y266 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
NUDCQ9Y266 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NUDCQ9Y266 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms