Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPS6

SETD1B, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1BQ9UPS6 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SETD1BQ9UPS6 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SETD1BQ9UPS6 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SETD1BQ9UPS6 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SETD1BQ9UPS6 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SETD1BQ9UPS6 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SETD1BQ9UPS6 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SETD1BQ9UPS6 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
SETD1BQ9UPS6 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SETD1BQ9UPS6 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
SETD1BQ9UPS6 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SETD1BQ9UPS6 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SETD1BQ9UPS6 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SETD1BQ9UPS6 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SETD1BQ9UPS6 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SETD1BQ9UPS6 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SETD1BQ9UPS6 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SETD1BQ9UPS6 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SETD1BQ9UPS6 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SETD1BQ9UPS6 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SETD1BQ9UPS6 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SETD1BQ9UPS6 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SETD1BQ9UPS6 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SETD1BQ9UPS6 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SETD1BQ9UPS6 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SETD1BQ9UPS6 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SETD1BQ9UPS6 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SETD1BQ9UPS6 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
SETD1BQ9UPS6 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
SETD1BQ9UPS6 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SETD1BQ9UPS6 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SETD1BQ9UPS6 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SETD1BQ9UPS6 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SETD1BQ9UPS6 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SETD1BQ9UPS6 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
SETD1BQ9UPS6 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SETD1BQ9UPS6 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SETD1BQ9UPS6 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
SETD1BQ9UPS6 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SETD1BQ9UPS6 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
SETD1BQ9UPS6 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SETD1BQ9UPS6 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SETD1BQ9UPS6 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SETD1BQ9UPS6 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SETD1BQ9UPS6 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SETD1BQ9UPS6 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SETD1BQ9UPS6 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SETD1BQ9UPS6 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
SETD1BQ9UPS6 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SETD1BQ9UPS6 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SETD1BQ9UPS6 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SETD1BQ9UPS6 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SETD1BQ9UPS6 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SETD1BQ9UPS6 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SETD1BQ9UPS6 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
SETD1BQ9UPS6 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SETD1BQ9UPS6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SETD1BQ9UPS6 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SETD1BQ9UPS6 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
SETD1BQ9UPS6 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SETD1BQ9UPS6 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SETD1BQ9UPS6 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SETD1BQ9UPS6 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SETD1BQ9UPS6 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SETD1BQ9UPS6 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SETD1BQ9UPS6 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SETD1BQ9UPS6 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SETD1BQ9UPS6 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SETD1BQ9UPS6 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SETD1BQ9UPS6 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SETD1BQ9UPS6 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SETD1BQ9UPS6 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SETD1BQ9UPS6 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SETD1BQ9UPS6 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
SETD1BQ9UPS6 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SETD1BQ9UPS6 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SETD1BQ9UPS6 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SETD1BQ9UPS6 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SETD1BQ9UPS6 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SETD1BQ9UPS6 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SETD1BQ9UPS6 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SETD1BQ9UPS6 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SETD1BQ9UPS6 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SETD1BQ9UPS6 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SETD1BQ9UPS6 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SETD1BQ9UPS6 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SETD1BQ9UPS6 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
SETD1BQ9UPS6 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SETD1BQ9UPS6 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
SETD1BQ9UPS6 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SETD1BQ9UPS6 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SETD1BQ9UPS6 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SETD1BQ9UPS6 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SETD1BQ9UPS6 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SETD1BQ9UPS6 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SETD1BQ9UPS6 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SETD1BQ9UPS6 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SETD1BQ9UPS6 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SETD1BQ9UPS6 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SETD1BQ9UPS6 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms