Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TTF2Q9UNY4 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TTF2Q9UNY4 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TTF2Q9UNY4 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TTF2Q9UNY4 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TTF2Q9UNY4 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TTF2Q9UNY4 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TTF2Q9UNY4 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TTF2Q9UNY4 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TTF2Q9UNY4 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TTF2Q9UNY4 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TTF2Q9UNY4 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TTF2Q9UNY4 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TTF2Q9UNY4 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TTF2Q9UNY4 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TTF2Q9UNY4 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TTF2Q9UNY4 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTF2Q9UNY4 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTF2Q9UNY4 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTF2Q9UNY4 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTF2Q9UNY4 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTF2Q9UNY4 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTF2Q9UNY4 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTF2Q9UNY4 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTF2Q9UNY4 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTF2Q9UNY4 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTF2Q9UNY4 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTF2Q9UNY4 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTF2Q9UNY4 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTF2Q9UNY4 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTF2Q9UNY4 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTF2Q9UNY4 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTF2Q9UNY4 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTF2Q9UNY4 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTF2Q9UNY4 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTF2Q9UNY4 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTF2Q9UNY4 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTF2Q9UNY4 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTF2Q9UNY4 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTF2Q9UNY4 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTF2Q9UNY4 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTF2Q9UNY4 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTF2Q9UNY4 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TTF2Q9UNY4 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TTF2Q9UNY4 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TTF2Q9UNY4 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TTF2Q9UNY4 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TTF2Q9UNY4 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TTF2Q9UNY4 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TTF2Q9UNY4 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TTF2Q9UNY4 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TTF2Q9UNY4 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TTF2Q9UNY4 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TTF2Q9UNY4 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TTF2Q9UNY4 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TTF2Q9UNY4 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TTF2Q9UNY4 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TTF2Q9UNY4 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TTF2Q9UNY4 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TTF2Q9UNY4 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TTF2Q9UNY4 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TTF2Q9UNY4 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TTF2Q9UNY4 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TTF2Q9UNY4 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TTF2Q9UNY4 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TTF2Q9UNY4 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TTF2Q9UNY4 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TTF2Q9UNY4 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TTF2Q9UNY4 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TTF2Q9UNY4 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TTF2Q9UNY4 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TTF2Q9UNY4 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TTF2Q9UNY4 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TTF2Q9UNY4 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TTF2Q9UNY4 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TTF2Q9UNY4 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TTF2Q9UNY4 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TTF2Q9UNY4 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TTF2Q9UNY4 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TTF2Q9UNY4 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TTF2Q9UNY4 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TTF2Q9UNY4 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TTF2Q9UNY4 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TTF2Q9UNY4 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TTF2Q9UNY4 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TTF2Q9UNY4 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TTF2Q9UNY4 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TTF2Q9UNY4 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TTF2Q9UNY4 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TTF2Q9UNY4 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TTF2Q9UNY4 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TTF2Q9UNY4 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TTF2Q9UNY4 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TTF2Q9UNY4 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TTF2Q9UNY4 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TTF2Q9UNY4 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TTF2Q9UNY4 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TTF2Q9UNY4 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TTF2Q9UNY4 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TTF2Q9UNY4 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms