Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNRF3Q9ULT6 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNRF3Q9ULT6 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNRF3Q9ULT6 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNRF3Q9ULT6 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNRF3Q9ULT6 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNRF3Q9ULT6 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNRF3Q9ULT6 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNRF3Q9ULT6 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNRF3Q9ULT6 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNRF3Q9ULT6 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNRF3Q9ULT6 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNRF3Q9ULT6 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNRF3Q9ULT6 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNRF3Q9ULT6 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNRF3Q9ULT6 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNRF3Q9ULT6 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNRF3Q9ULT6 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNRF3Q9ULT6 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNRF3Q9ULT6 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNRF3Q9ULT6 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNRF3Q9ULT6 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNRF3Q9ULT6 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNRF3Q9ULT6 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNRF3Q9ULT6 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNRF3Q9ULT6 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNRF3Q9ULT6 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNRF3Q9ULT6 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNRF3Q9ULT6 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNRF3Q9ULT6 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNRF3Q9ULT6 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNRF3Q9ULT6 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNRF3Q9ULT6 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNRF3Q9ULT6 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNRF3Q9ULT6 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNRF3Q9ULT6 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNRF3Q9ULT6 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNRF3Q9ULT6 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNRF3Q9ULT6 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNRF3Q9ULT6 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNRF3Q9ULT6 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNRF3Q9ULT6 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNRF3Q9ULT6 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNRF3Q9ULT6 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNRF3Q9ULT6 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNRF3Q9ULT6 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNRF3Q9ULT6 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNRF3Q9ULT6 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNRF3Q9ULT6 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNRF3Q9ULT6 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNRF3Q9ULT6 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNRF3Q9ULT6 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNRF3Q9ULT6 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNRF3Q9ULT6 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNRF3Q9ULT6 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNRF3Q9ULT6 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNRF3Q9ULT6 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNRF3Q9ULT6 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNRF3Q9ULT6 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNRF3Q9ULT6 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNRF3Q9ULT6 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNRF3Q9ULT6 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNRF3Q9ULT6 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNRF3Q9ULT6 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNRF3Q9ULT6 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNRF3Q9ULT6 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNRF3Q9ULT6 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNRF3Q9ULT6 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNRF3Q9ULT6 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNRF3Q9ULT6 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNRF3Q9ULT6 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNRF3Q9ULT6 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNRF3Q9ULT6 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNRF3Q9ULT6 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNRF3Q9ULT6 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNRF3Q9ULT6 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNRF3Q9ULT6 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNRF3Q9ULT6 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNRF3Q9ULT6 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNRF3Q9ULT6 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNRF3Q9ULT6 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNRF3Q9ULT6 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNRF3Q9ULT6 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNRF3Q9ULT6 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNRF3Q9ULT6 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNRF3Q9ULT6 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNRF3Q9ULT6 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNRF3Q9ULT6 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNRF3Q9ULT6 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNRF3Q9ULT6 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNRF3Q9ULT6 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNRF3Q9ULT6 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNRF3Q9ULT6 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNRF3Q9ULT6 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNRF3Q9ULT6 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNRF3Q9ULT6 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNRF3Q9ULT6 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNRF3Q9ULT6 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNRF3Q9ULT6 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNRF3Q9ULT6 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms