Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULK4

MED23, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 23, humanhuman

Predictions only

Length 1,368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED23Q9ULK4 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MED23Q9ULK4 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MED23Q9ULK4 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MED23Q9ULK4 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MED23Q9ULK4 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MED23Q9ULK4 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MED23Q9ULK4 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MED23Q9ULK4 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MED23Q9ULK4 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MED23Q9ULK4 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MED23Q9ULK4 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MED23Q9ULK4 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MED23Q9ULK4 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MED23Q9ULK4 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MED23Q9ULK4 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MED23Q9ULK4 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MED23Q9ULK4 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
MED23Q9ULK4 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MED23Q9ULK4 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MED23Q9ULK4 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MED23Q9ULK4 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MED23Q9ULK4 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MED23Q9ULK4 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
MED23Q9ULK4 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MED23Q9ULK4 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MED23Q9ULK4 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MED23Q9ULK4 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MED23Q9ULK4 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MED23Q9ULK4 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MED23Q9ULK4 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MED23Q9ULK4 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MED23Q9ULK4 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MED23Q9ULK4 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MED23Q9ULK4 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MED23Q9ULK4 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MED23Q9ULK4 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MED23Q9ULK4 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MED23Q9ULK4 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC23■■□□□ 1.27
MED23Q9ULK4 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC23■■□□□ 1.27
MED23Q9ULK4 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MED23Q9ULK4 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MED23Q9ULK4 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC23■■□□□ 1.27
MED23Q9ULK4 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MED23Q9ULK4 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MED23Q9ULK4 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MED23Q9ULK4 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MED23Q9ULK4 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MED23Q9ULK4 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MED23Q9ULK4 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MED23Q9ULK4 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MED23Q9ULK4 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MED23Q9ULK4 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MED23Q9ULK4 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MED23Q9ULK4 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MED23Q9ULK4 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MED23Q9ULK4 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MED23Q9ULK4 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MED23Q9ULK4 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MED23Q9ULK4 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MED23Q9ULK4 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MED23Q9ULK4 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MED23Q9ULK4 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
MED23Q9ULK4 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MED23Q9ULK4 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MED23Q9ULK4 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
MED23Q9ULK4 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MED23Q9ULK4 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
MED23Q9ULK4 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MED23Q9ULK4 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
MED23Q9ULK4 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MED23Q9ULK4 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
MED23Q9ULK4 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
MED23Q9ULK4 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MED23Q9ULK4 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MED23Q9ULK4 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MED23Q9ULK4 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MED23Q9ULK4 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MED23Q9ULK4 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MED23Q9ULK4 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MED23Q9ULK4 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MED23Q9ULK4 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MED23Q9ULK4 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MED23Q9ULK4 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MED23Q9ULK4 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
MED23Q9ULK4 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MED23Q9ULK4 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MED23Q9ULK4 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
MED23Q9ULK4 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MED23Q9ULK4 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MED23Q9ULK4 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MED23Q9ULK4 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
MED23Q9ULK4 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
MED23Q9ULK4 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
MED23Q9ULK4 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MED23Q9ULK4 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MED23Q9ULK4 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
MED23Q9ULK4 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MED23Q9ULK4 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MED23Q9ULK4 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MED23Q9ULK4 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms