Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ63

C9orf78, Telomere length and silencing protein 1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf78Q9NZ63 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C9orf78Q9NZ63 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C9orf78Q9NZ63 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C9orf78Q9NZ63 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C9orf78Q9NZ63 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C9orf78Q9NZ63 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
C9orf78Q9NZ63 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C9orf78Q9NZ63 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C9orf78Q9NZ63 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C9orf78Q9NZ63 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
C9orf78Q9NZ63 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C9orf78Q9NZ63 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C9orf78Q9NZ63 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C9orf78Q9NZ63 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C9orf78Q9NZ63 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C9orf78Q9NZ63 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C9orf78Q9NZ63 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C9orf78Q9NZ63 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C9orf78Q9NZ63 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C9orf78Q9NZ63 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C9orf78Q9NZ63 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C9orf78Q9NZ63 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C9orf78Q9NZ63 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
C9orf78Q9NZ63 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C9orf78Q9NZ63 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C9orf78Q9NZ63 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C9orf78Q9NZ63 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C9orf78Q9NZ63 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C9orf78Q9NZ63 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C9orf78Q9NZ63 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C9orf78Q9NZ63 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
C9orf78Q9NZ63 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C9orf78Q9NZ63 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C9orf78Q9NZ63 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
C9orf78Q9NZ63 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C9orf78Q9NZ63 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C9orf78Q9NZ63 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C9orf78Q9NZ63 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C9orf78Q9NZ63 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C9orf78Q9NZ63 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
C9orf78Q9NZ63 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C9orf78Q9NZ63 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C9orf78Q9NZ63 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
C9orf78Q9NZ63 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
C9orf78Q9NZ63 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
C9orf78Q9NZ63 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
C9orf78Q9NZ63 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
C9orf78Q9NZ63 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C9orf78Q9NZ63 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
C9orf78Q9NZ63 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
C9orf78Q9NZ63 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C9orf78Q9NZ63 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C9orf78Q9NZ63 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
C9orf78Q9NZ63 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C9orf78Q9NZ63 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C9orf78Q9NZ63 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C9orf78Q9NZ63 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C9orf78Q9NZ63 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C9orf78Q9NZ63 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C9orf78Q9NZ63 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
C9orf78Q9NZ63 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C9orf78Q9NZ63 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C9orf78Q9NZ63 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
C9orf78Q9NZ63 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C9orf78Q9NZ63 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C9orf78Q9NZ63 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C9orf78Q9NZ63 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C9orf78Q9NZ63 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C9orf78Q9NZ63 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C9orf78Q9NZ63 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C9orf78Q9NZ63 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
C9orf78Q9NZ63 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
C9orf78Q9NZ63 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C9orf78Q9NZ63 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C9orf78Q9NZ63 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C9orf78Q9NZ63 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
C9orf78Q9NZ63 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
C9orf78Q9NZ63 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C9orf78Q9NZ63 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C9orf78Q9NZ63 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
C9orf78Q9NZ63 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C9orf78Q9NZ63 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C9orf78Q9NZ63 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C9orf78Q9NZ63 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C9orf78Q9NZ63 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C9orf78Q9NZ63 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C9orf78Q9NZ63 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C9orf78Q9NZ63 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C9orf78Q9NZ63 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C9orf78Q9NZ63 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
C9orf78Q9NZ63 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C9orf78Q9NZ63 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
C9orf78Q9NZ63 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
C9orf78Q9NZ63 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C9orf78Q9NZ63 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C9orf78Q9NZ63 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C9orf78Q9NZ63 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
C9orf78Q9NZ63 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
C9orf78Q9NZ63 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
C9orf78Q9NZ63 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms