Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYL9

TMOD3, Tropomodulin-3, humanhuman

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Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3Q9NYL9 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMOD3Q9NYL9 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMOD3Q9NYL9 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMOD3Q9NYL9 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMOD3Q9NYL9 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMOD3Q9NYL9 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMOD3Q9NYL9 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMOD3Q9NYL9 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMOD3Q9NYL9 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMOD3Q9NYL9 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TMOD3Q9NYL9 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMOD3Q9NYL9 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMOD3Q9NYL9 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMOD3Q9NYL9 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMOD3Q9NYL9 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMOD3Q9NYL9 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMOD3Q9NYL9 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMOD3Q9NYL9 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMOD3Q9NYL9 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMOD3Q9NYL9 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMOD3Q9NYL9 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMOD3Q9NYL9 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMOD3Q9NYL9 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMOD3Q9NYL9 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMOD3Q9NYL9 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMOD3Q9NYL9 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMOD3Q9NYL9 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TMOD3Q9NYL9 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TMOD3Q9NYL9 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMOD3Q9NYL9 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMOD3Q9NYL9 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMOD3Q9NYL9 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMOD3Q9NYL9 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMOD3Q9NYL9 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMOD3Q9NYL9 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMOD3Q9NYL9 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMOD3Q9NYL9 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMOD3Q9NYL9 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMOD3Q9NYL9 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMOD3Q9NYL9 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMOD3Q9NYL9 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMOD3Q9NYL9 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMOD3Q9NYL9 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMOD3Q9NYL9 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMOD3Q9NYL9 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMOD3Q9NYL9 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMOD3Q9NYL9 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMOD3Q9NYL9 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMOD3Q9NYL9 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMOD3Q9NYL9 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMOD3Q9NYL9 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMOD3Q9NYL9 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMOD3Q9NYL9 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMOD3Q9NYL9 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMOD3Q9NYL9 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMOD3Q9NYL9 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMOD3Q9NYL9 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMOD3Q9NYL9 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMOD3Q9NYL9 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TMOD3Q9NYL9 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMOD3Q9NYL9 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TMOD3Q9NYL9 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMOD3Q9NYL9 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMOD3Q9NYL9 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMOD3Q9NYL9 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMOD3Q9NYL9 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMOD3Q9NYL9 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMOD3Q9NYL9 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMOD3Q9NYL9 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TMOD3Q9NYL9 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMOD3Q9NYL9 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMOD3Q9NYL9 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMOD3Q9NYL9 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMOD3Q9NYL9 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMOD3Q9NYL9 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMOD3Q9NYL9 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMOD3Q9NYL9 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMOD3Q9NYL9 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMOD3Q9NYL9 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMOD3Q9NYL9 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMOD3Q9NYL9 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMOD3Q9NYL9 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMOD3Q9NYL9 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMOD3Q9NYL9 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMOD3Q9NYL9 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TMOD3Q9NYL9 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMOD3Q9NYL9 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TMOD3Q9NYL9 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMOD3Q9NYL9 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMOD3Q9NYL9 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMOD3Q9NYL9 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMOD3Q9NYL9 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TMOD3Q9NYL9 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMOD3Q9NYL9 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMOD3Q9NYL9 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMOD3Q9NYL9 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMOD3Q9NYL9 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMOD3Q9NYL9 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TMOD3Q9NYL9 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TMOD3Q9NYL9 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
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