Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVU0

POLR3E, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC5, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3EQ9NVU0 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLR3EQ9NVU0 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLR3EQ9NVU0 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLR3EQ9NVU0 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLR3EQ9NVU0 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLR3EQ9NVU0 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLR3EQ9NVU0 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLR3EQ9NVU0 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLR3EQ9NVU0 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLR3EQ9NVU0 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLR3EQ9NVU0 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLR3EQ9NVU0 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLR3EQ9NVU0 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLR3EQ9NVU0 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLR3EQ9NVU0 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLR3EQ9NVU0 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLR3EQ9NVU0 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLR3EQ9NVU0 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
POLR3EQ9NVU0 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
POLR3EQ9NVU0 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLR3EQ9NVU0 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLR3EQ9NVU0 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
POLR3EQ9NVU0 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLR3EQ9NVU0 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLR3EQ9NVU0 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLR3EQ9NVU0 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLR3EQ9NVU0 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLR3EQ9NVU0 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLR3EQ9NVU0 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLR3EQ9NVU0 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLR3EQ9NVU0 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLR3EQ9NVU0 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
POLR3EQ9NVU0 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLR3EQ9NVU0 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLR3EQ9NVU0 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLR3EQ9NVU0 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLR3EQ9NVU0 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLR3EQ9NVU0 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLR3EQ9NVU0 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLR3EQ9NVU0 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLR3EQ9NVU0 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLR3EQ9NVU0 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLR3EQ9NVU0 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLR3EQ9NVU0 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLR3EQ9NVU0 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLR3EQ9NVU0 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLR3EQ9NVU0 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLR3EQ9NVU0 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
POLR3EQ9NVU0 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLR3EQ9NVU0 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLR3EQ9NVU0 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLR3EQ9NVU0 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
POLR3EQ9NVU0 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLR3EQ9NVU0 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLR3EQ9NVU0 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLR3EQ9NVU0 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
POLR3EQ9NVU0 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLR3EQ9NVU0 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLR3EQ9NVU0 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLR3EQ9NVU0 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLR3EQ9NVU0 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLR3EQ9NVU0 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
POLR3EQ9NVU0 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
POLR3EQ9NVU0 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
POLR3EQ9NVU0 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLR3EQ9NVU0 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLR3EQ9NVU0 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLR3EQ9NVU0 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLR3EQ9NVU0 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLR3EQ9NVU0 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLR3EQ9NVU0 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLR3EQ9NVU0 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLR3EQ9NVU0 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLR3EQ9NVU0 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLR3EQ9NVU0 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLR3EQ9NVU0 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLR3EQ9NVU0 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLR3EQ9NVU0 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLR3EQ9NVU0 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLR3EQ9NVU0 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLR3EQ9NVU0 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
POLR3EQ9NVU0 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLR3EQ9NVU0 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLR3EQ9NVU0 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLR3EQ9NVU0 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLR3EQ9NVU0 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLR3EQ9NVU0 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLR3EQ9NVU0 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLR3EQ9NVU0 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR3EQ9NVU0 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR3EQ9NVU0 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR3EQ9NVU0 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR3EQ9NVU0 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR3EQ9NVU0 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR3EQ9NVU0 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR3EQ9NVU0 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR3EQ9NVU0 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR3EQ9NVU0 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR3EQ9NVU0 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR3EQ9NVU0 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms